音乐学系的专业内容丰富，涉及多个领域。首先是西方音乐史，研究内容包括西方音乐的发展历程、主要作曲家和演奏家的艺术贡献、音乐理论及体裁演变，以及音乐与社会历史的关系。
接着是民族音乐理论，它涵盖了广义与狭义两种概念，强调中国各民族音乐的多样性和历史变迁。如汉族的民间音乐，如民族器乐，拥有丰富的分类和独特的表演形式，如吹管、拉弦、弹弦和打击乐器，以及各种合奏形式，如鼓乐、丝竹乐等。
说唱艺术在中国历史悠久，如东汉时期的说书俑，以及宋元明清时期的“诸宫调”和各种曲种。民歌舞则展示了我国从远古到现代的舞蹈艺术发展，以及汉族与少数民族的歌舞形式和特色。
民歌部分，从《诗经》到现代，展现了我国丰富的民间音乐传统，如西部歌王王洛宾的歌曲和各地特色山歌。戏曲音乐方面，以川剧为例，其生动的生活气息和丰富的剧目展现了中国戏曲的魅力。
此外，音乐治疗学作为新兴学科，近年来在中国得到了快速发展，不仅应用于精神科和心身疾病治疗，还在教育领域，如四川音乐学院，开始培养音乐治疗的专业人才，为构建中国特色的音乐治疗做出了贡献。
音乐学系建立于1994年3月，首任系主任颜曼秋，现任党总支副书记蒋茂高、系主任甘绍成、副系主任李兴梧。目前共有在职教师和行政人员10人，其中教授1人、副教授3人、讲师3人、书记1人、辅导员1人。该系设有硕士、本科两个教学层次，其中硕士研究生2年，本科生5年。主要专业方向有中国音乐史、西方音乐史、民族音乐理论、宗教音乐、少数民族音乐等。现有本科生58人、硕士生7人。设有音乐史论和民族音乐理论两个教研室。 音乐学系的前身是上个世纪八十年代初成立的民族音乐研究室和1986年扩建的音乐研究所。