文宗阁与文汇阁是乾隆年间为收藏《古今图书集成》而建于镇江金山寺和扬州天宁寺的两座藏书楼。文宗阁于乾隆四十四年（1779）竣工，文汇阁紧随其后。两阁均收藏了《古今图书集成》，并在太平天国运动期间遭到了严重破坏。文澜阁原在杭州圣因寺，于乾隆四十七年改建，虽在太平军攻占杭州时受损，但仍有残存，现藏于浙江省图书馆。文津阁位于承德避暑山庄，文溯阁在沈阳故宫，文渊阁则在紫禁城内的主敬殿后，各阁都在其成书时期藏有《四库全书》的部分内容，其中文津阁本保存较为完整，现藏国家图书馆。文宗阁和文汇阁在太平天国时被毁，文源阁则因英法联军焚烧圆明园而化为灰烬。文溯阁经历战乱后辗转，现存甘肃省图书馆。文渊阁经历民国时期，现藏台北故宫博物院。《四库全书》各阁的成书、藏书及毁损情况反映了清代对文化典籍的保护和历史的波折。
文津阁本《四库全书》作为国家图书馆的珍品，具有极高的历史价值，其完整性和乾隆御笔校核使得它在学术研究中占有重要地位。其他阁本虽各有损失，但文津阁本的完整保存为研究提供了重要线索。同时，乾隆编纂《四库全书》的目的和影响引发了对文化遗产保护和历史评价的讨论，如文化控制、保存与禁锢、以及文字狱的影响等。在现代社会，尽管《四库全书》的原件保存有限，但其电子版和现代出版物的出现，使文化传承得以延续，同时也引发了关于是否需要继续编纂此类大部头书籍的思考。
《四库全书》是乾隆皇帝在“文字狱”的背景下亲自组织的中国历史上一部规模最大的丛书。1772年开始，经十年编成。丛书分经、史、子、集四部，故名四库。据文津阁藏本，该书共收录古籍3503种、79337卷、装订成三万六千余册，保存了丰富的文献资料，但编纂过程毁书则更多。“四库”之名，是初唐官方藏书分为经史子集四个书库，号称“四部库书”，或“四库之书”。经、史、子、集四分法是古代图书分类的主要方法，它基本上囊括了古代所有图书，故称“全书”。清代乾隆初年，学者周永年提出“儒藏说”，主张把儒家著作集中在一起，供人借阅。