区别一、两者的运营时间不相同
中通快运是2016年8月26日开始运营的。而中通快递股份有限公司是从2002年5月8日在上海成立并运营的，当日全网业务量仅57票。
区别二、两者的运作模式不相同
中通快运在运作模式上，采用“中心直营+加盟网点”的扁平化组织和管理，力争在最短的时间内，采用现代化的作业设备、信息化管理系统以及全国统一的高标准作业流程，创建一流的物流供应链管理服务平台。而中通快递是一家集快递、物流及别的业务于一体的运作。
区别三、两者的发展历程不相同
中通快运自2016年8月26日开始运营以来，在不到三个月的时间，分拨中心由14个增加至40多个，发货重量由日均几百公斤迅速增长至逾千吨，全国网点发展逾1500家。
中通快递于2005年率先在民营快递业中开通长三角至广东、北京的跨省际班车。到2009年中通快递的日均业务量增至50万票，全年营业总收入达30亿。到2011年日均业务量至100万票，投资营建东莞、台州、无锡等拥有自主产权的分拨中心。
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区别四、两者的服务对象不相同
中通快运有别于中通快递，中通快运服务对象在重量、数量、体积上有时候会与中通快递重叠，但基本上都比快递的运输对象大；中通快运以做门到门服务为主要产品，直接将货物送到终端收货人手中。
区别五、两者的优劣势不相同
中通快运对于干线运输的依赖程度大，需要投入大量资金购买大型卡车等硬件设备，而中通快运业务多数的回款周期较长。快递企业抢滩快运市场，有优势也有难以避免的问题。
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