大渡口区综合行政执法局是一个设有职能部门的单位，主要由两大部分组成：办公室（挂政策法规科）和执法监督科。
办公室的主要职责包括：负责局机关的党务、政务日常管理工作，如公文处理、信息档案、人事党务、财务、保密、接待联络和会议组织等。此外，他们还负责起草重要文件，监督局长办公会决定事项的执行，处理信访来访，以及办理人大议案和政协提案。在法律方面，他们负责综合行政执法相关法规的学习、培训和宣传，以及行政复议、赔偿案件和诉讼代理的准备工作，组织行政处罚听证，并负责队伍建设培训。
执法监督科则承担全局的行政执法监督工作，制定工作计划，对各执法大队的执法工作进行检查、考核和指导，调度专项执法活动，并负责执法队伍建设和队容风纪检查。他们还负责执法案卷的检查和行政执法投诉的处理。
该局下设四个执法大队，每个大队都以区综合行政执法局的名义在特定行政区域行使行政监督处罚职能。例如：
这些大队在各自区域范围内，作为区综合行政执法局的派出机构，执行具体的行政监督和处罚任务。
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