截至2012年12月底，全院共有在职职工1963人，其中：具有博士学位的192人，硕士学位412人；具有高级专业技术资格科技人员341人。学院有享受政府特殊津贴专家24人、“百千万人才工程”国家级人选3人、“全国杰出专业技术人才”1人和“全国优秀青年科学家”1人，入选国家现代农业产业技术体系岗位科学家17人、综合试验站站长7人，入选省现代农业产业技术体系创新团队首席专家3人、岗位专家23人。
百千万人才人选：蒋宗勇、张名位、舒鼎铭
省现代农业技术体系专家：李康活、李映波、王富华、吕复兵、朱根发、徐培智、张雁、徐玉娟、张名位、宋长绪、郑春田、蔡更元、万忠、潘学文、邱燕萍
国家现代农业技术体系专家：蒋宗勇、廖森泰、陈栋、肖更生、易干军、李家贤、姚丽贤、罗国庆、林映才、舒鼎铭、马培恰、袁沛元、欧良喜、钟广炎、陈景益、房伯平、胡建广、李少雄、梁炫强、陈炳旭、朱小源、罗少波、王丰 据2015年12月科学院官网信息显示，全院有15个科研机构。建有国家重点实验室1个，省级重点实验室12个，农业部重点实验室5个，省部共建国家重点实验室培育基地1个，广东省公共实验室3个，广东省重点实验室12个，科技部国际科技合作基地1个。
国家重点实验室：畜禽育种国家重点实验室
省级重点实验室：广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室、广东茶树资源创新利用重点实验室、广东省养分资源循环利用与耕地保育重点实验室、广东省蔬菜新技术研究重点实验室、广东省热带亚热带果树研究重点实验室、广东省农作物遗传改良重点实验室、广东省功能食品研究重点实验室、广东省果蔬深加工重点实验室、广东省畜禽疫病防治研究重点实验室、广东省植物保护新技术重点实验室、广东省水稻育种新技术重点实验室、广东省畜禽饲料研究实验室
农业部重点实验室：农业部农产品质量安全检测与评价重点实验室、农业部功能食品重点开放实验室、农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室、农业部南方植物营养与肥料重点实验室、农业部华南动物营养与饲料重点实验室
省部共建国家重点实验室培育基地：广东省农产品加工重点实验室
院级科研机构：水稻研究所、蔬菜研究所、植物保护研究所、作物研究所、果树研究所、农业经济与农村发展研究所、动物科学研究所、动物卫生研究所、蚕业与农产品加工研究所、农业资源与环境研究所、环境园艺研究所、饮用植物研究所（茶叶研究中心）、农业生物基因研究中心、农产品公共监测中心、农业科研试验示范场 据2015年12月科学院官网信息显示，科学院收集保存中国国内外种质资源4万多份。建有占地2000亩的现代农业科技园区——广东广州国家农业科技园区，为国家级农业科技创新与集成示范基地。以省农科院为依托，省政府与中国农业科学院联合共建中国农业科技华南创新中心，建成面积3.6万平方米的创新大楼，购置、安装了价值1亿多元、具有国际先进水平的科研仪器设备。有国家种质资源圃6个，农业部种质资源圃2个，省市共建种质资源圃（库）11个。
国家种质资源圃： 国家种质资源圃国家桑树种质资源圃华南分圃国家种质广州野生稻圃国家种质广州甘薯圃国家茶树种质资源圃华南分圃国家果树种质-广州荔枝圃国家果树种质-广州香蕉圃 农业部种质资源圃： 农业部种质资源圃 农业部广州荔枝种质资源圃农业部广州香蕉种质资源圃 据2015年12月科学院官网信息显示，2001年以来，科学院与30个国家和地区的科技机构、国际科技组织开展了学术交流活动，先后与国际水稻所（IRRI）、国际热带农业中心（CIAT）、亚洲蔬菜发展研究中心（AVRDC）等26个中国国外科研机构和大学开展实质性合作。2007年，国家科技部和广东省科技厅授牌该院为国际科技合作基地。近年来先后承办了第三届国际香根草大会、首届国际花生黄曲霉和基因组大会、第二届国际香大蕉会议、第四届亚洲球虫病学术研讨会、优质肉鸡育种国际研讨会等多个国际学术会议。2010年将举办第五届国际热带亚热带果树研讨会。
截至2011年12月，科学院有以下国际合作伙伴及合作领域： 合作伙伴合作领域国际水稻研究所（IRRI）
International Rice Research Institute 水稻抗性育种与栽培 美国Arizona州立大学,美国Ohio州立大学
Arizona State University, Ohio State University, USA 日本兵库县立中央农业技术中心
Hyogo Prefectural Technology Center for Agriculture, Forestry and Fisheries,Japan 国际半干旱和热带作物研究所（ICRISAT）
International Crops Research Institute for the Semi-Arid tropic (ICRISAT) 花生抗黄曲霉育种及功能基因组研究 美国农业部农业研究局
Unite States Department of Agriculture, Agricultural Research Service (USDA-ARS) 菲律宾农业部、菲律宾华商联、菲律宾大学
Department of Agriculture of the Philippines, Federation of Filipino-Chines Chambers of Commerce and Industry,Inc.
University of the Philippines 热带亚热带农业新品种和新技术研究与推广 国际马铃薯中心（CIP）
International Potato Center 甘薯转基因品系蚁象抗性鉴定研究 国际生物多样性组织
Bioversity International
国际香大蕉网络（INIBAP）
International Network for improvement of banana and plantain
国际热带水果网络组织（TFNet）
1.International Tropical Fruits Network 热带亚热带果树种质资源利用与创新 俄罗斯科学院生物发育研究所
Institute of Biology, Russian Academy of Sciences 桔小实蝇分子改造研究 哥斯达黎加热带农业研究和高等教育中心Costa Ricacenter of tropical agriculture research and high education 香蕉抗枯萎病新品种选育及其快繁技术示范推广 南非STELLENBOSCH大学
STELLENBOSCHUNIVERSITY, SOUTH AFRICA 巴西国家木薯与热带果树研究中心
（Cassava and Tropical Fruits,EMBRAPA） 国际热带农业研究所
（International Institute of Tropical Agriculture,IITA） 康奈尔大学蛋白质组学和质谱分析中心
Cornell University 马达加斯加FRIGOTA公司
MadagascarFRIGOTA company 荔枝高产优质关键技术研究与示范 亚洲蔬菜研究发展中心
Asian Vegetable Research and Development Center 蔬菜病虫持续控制 马来西亚GREEN WORLD GENETICS SDN.BHD公司 蔬菜新品种和新技术研究与推广 国际植物营养研究所（IPNI）
Institute of International Plant Nutrition 土壤养分系统研究法、控释肥包膜工艺和技术研究 英国国立动物卫生研究所
Institute for Animal Health, UK 鸡球虫病研究 美国德洲A&M大学兽医学院
College of Veterinary and Biomedicine, Texas A & M University, the USA 美国南达科达州立大学
SOUTH DAKOTA STATE UNIVERSITY,USA 动物疫病诊断和研究 美国德州农工大学
Texas A&M University. the USA 瘦肉型母猪繁殖性能的遗传改良与营养调控研究 美国康奈尔大学
Cornell University, the USA 高温条件下猪氧化应激产生机理及抗氧化调控技术与产品的研究开发 美国夏威夷大学热带农业和人力资源学院 动物及水产基础与应用科学 美国普度大学（植保所译）
Purdue University 红火蚁群落生态学与防控技术 东盟国家
ASEAN 中国-东盟重大农业外来有害生物预警与防控平台 柬埔寨农业研究与发展研究所
Cambodian Agricultural Research & Development Institute，CARDI 水稻高产安全种植关键技术应用与示范推广 美国亚利桑那大学
The University of Arizona 作物双生病毒研究 澳大利亚食品科学研究所
Food Science Australia 农产品精深加工 美国康奈尔大学农业与生命科学学院食品科学系
Department of Food Science, Cornell University 加拿大农业部Guelph食品科学研究中心
Guelph Food Research Centre of the Ministry of Agriculture, Canada 越南国家农业科学院
Vietnamese Academy of Agricultural Sciences 热带亚热带农业新品种和新技术研究与推广
