明确回答：《名侦探柯南》工藤新一出场的集数如下：
云霄飞车杀人事件（还没变小）
董事长千金绑架事件 （兰的回忆&.远影）
偶像密室杀人事件（远影）
每月一件礼物威胁事件 (远影)
足球选手恐吓事件 (照片、兰幻想新一和另一个女生接吻，投影)
六月新娘杀人事件 （回忆)
爱犬约翰杀人事件 (回忆）
咖啡店杀人事件 (回忆）
卡拉OK厅杀人事件 (远影）
外交官杀人事件(后编) （喝白干酒变大)
福尔摩斯迷杀人事件(前编) (回忆)
夜路杀人事件（影子－在星空出现的）
暗夜公爵杀人事件(解决编)（回忆）
柯南对怪盗基德 (远影)
名门连续惨死事件(后编)(远影)
滑雪别墅杀人事件(前编) (回忆）
走投无路的名侦探 连续两大杀人事件 (照片，想像)
名陶艺家杀人事件(前编) (想像)
初恋情人回忆事件(前编) (回忆)
初恋情人回忆事件(后编) (回忆）
浪花连续杀人事件 (平次的梦－－工藤被袭击)
来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 (远影)
上野出发北斗星3号(前编) (回忆）
月与星与太阳的秘密(前编)（远影）
危命的复活～第三种选择(平次扮的)
危命的复活～黑衣骑士 (变回新一了，帅呀)
危命的复活～新一回来了
危命的复活～约定的场所(结尾变回新一)
名侦探大集合 工藤新一vs怪盗基德 (回忆)
偶像们的秘密(后编) (星野辉美手中的剪报)
本厅刑事恋爱物语4 (前编)（想像）
本厅刑事恋爱物语4 (后编)（想像+远影）
松江玉造连句十四次胜负(前编) (柯南回忆)
大阪双重神秘 浪花剑士和太阁之城 （兰的期望）
急忙掩饰的忽略(前编)（远影）
英语教师VS西部名侦探(后编)（照片）
中华街雨中的似曾相识(后编) (兰的错觉)
工藤新一NY事件(事件编) (回忆）
工藤新一NY事件(推理编) (回忆）
工藤新一NY事件(解决编) (回忆）
友情与杀意的关门海峡(后编) (兰的错觉）
震动的警视厅 1200万人质 (兰的错觉+远影）
与黑暗组织接触(交涉编)（远影）
被挑拨的友情（后篇）(回忆)
疑惑的咖喱饭（上篇）(想像)
便利店中的阴谋(前篇)(回忆+远影)
便利店中的阴谋(后篇) (错觉、照片+远影)
直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件（假扮、照片+回忆）
寻找P股上的印记(前篇) （照片）
解开桃太郎之迷(前篇）
来自甲子园的恶魔的挑战（兰的回忆）
斯特拉蒂瓦里的不谐和音（尾曲）（柯南回忆自己唱歌）
奇妙一家的委托(前篇)(想像）
心存疑惑的兰(回忆、想像+远影）
同时进行的舞台剧和绑架案(前篇)（回忆）
同时进行的舞台剧和绑架案(后篇)（回忆）
银杏色的初恋(后篇)（回忆）
黑色冲击!黑色组织伸出魔爪的瞬间!（远影）
服部平次3年前的事件（回忆）
少年工藤新一的冒险(前篇)
少年工藤新一的冒险 (后篇)
杀人犯、工藤新一（以其身份登场的是个整容的犯人）
新一的真实身份和兰的眼泪
真正想问的事
拓展资料：
《名侦探柯南》是根据日本漫画家青山刚昌创作的侦探漫画《名侦探柯南》改编的同名推理动画作品系列。其中电视动画由V1 Studio制作，于1996年1月8日开始在日本读卖电视台播放，至今仍在播出。
参考资料：百度百科《名侦探柯南》