采集草本植物通常是选择典型、完整的进行全株挖取。扎根较浅，土壤疏松时，可用手提、手拔；根系较深、土质较硬时，不可轻易拔取，要用小铁铲在根部周围松土浅挖，顺势将植株提出；有的还要用小铁锹深挖，扩大挖面，待露出主根后再设法取出，以防折断主根。
所谓典型，是指所采的标本要具有明显的分类特征，在同种植物中有较强的代表性。所谓完整，是指整株标本的根、茎、叶、花、果俱全，并基本完好无损。由于植物的生长发育阶段不同，遇到尚未开花、结果时，可先采下植株，留下标记，记下采集地点，等到花、果期再来补采配齐。每种植物标本一般采集3~5份，以后要用于教学的标本以及珍稀、奇异或有重大经济价值的植物，可酌量多采几份。
寄生植物如菟丝子、桑寄生等，采集时要把它们的寄主植物也采下一些，两种标本放在一起，并注明它们之间的关系。有些植株上的部分结构是分类鉴定时的重要依据，则应尽量选取采齐，如十字花科、伞形科、槭树科、紫草科植物的果实，沙参属、益母草属及伞形科的基部和茎上的叶片，兰科、杜鹃属等植物的花，百合科、兰科、薯蓣科、天南星科、石蒜科、莎草科、茄科、旋花科、桔梗科等某些植物的地下部分（球茎、块根、鳞茎、块茎、圆锥根），以及鸢尾科、蕨类植物的根状茎等，都是分类上的重要依据，有匍匐茎的植物应和新生的植株一并采下。
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