2014年7月学院官网显示，学院在编职工1370人（含直属附属医院），教师761人，具有研究生以上学历529人，博士学位162人，具有高级职称403人，其中正高156人。拥有国务院突出贡献专家1人，享受国务院政府特殊津贴专家5人，全国老中医药专家学术经验继承指导教师13人，云南省中医师带徒工作指导老师5人，省级突出贡献专家3人，享受省人民政府特殊津贴专家3人，省名中医、荣誉名中医24人，省中青年学术技术带头人5名、后备人才4名，省优秀中青年中医药领军人才2人。省级教学团队4个，校级教学团队4个，省级教学名师8人。
省级教学团队（4个） ： 序号项目名称项目负责人所属机构年份1药理学基础与实验教学团队林青中药学院20112中药资源学教学团队钱子刚中药学院20123中医临床教学团队秦国政临床医学院20094中西医基础医学教学团队袁嘉丽基础医学院2010校级教学团队（4个） ： 序号项目名称项目负责人所属机构年份1中医经典教学团队陈文慧基础医学院20132中药资源学教学团队钱子刚中药学院20123中医临床教学团队秦国政临床医学院20094中西医基础医学教学团队袁嘉丽基础医学院2010 2014年7月学院官网显示，学院建有国家级特色专业建设点2个、省级重点专业建设点5个、省级特色专业建设点5个。有国家级专业综合改革试点1个、省级专业综合改革试点3个，省级精品视频公开课2个，省级精品课程17个，省级名师工作室7个，省级实验教学示范中心3个，省级人才培养模式创新实验区1个。
国家级特色专业建设点（2个）：中药学专业、中医学专业
省级特色专业建设点（5个）：中医学、中药学、制药工程、针灸推拿学、中西医临床医学
国家级专业综合改革试点（1个）：中医学
省级实验教学示范中心（3个）：中医临床技能综合模拟实验教学中心、基础医学实验教学示范中心、中药学实验教学示范中心
省级人才培养模式创新实验区（1个）：中医学专业
省级精品课程（17个）：
中医基础理论、方剂学、中医诊断学、温病学、免疫学基础与病原生物学、正常人体解剖学、病理学、药理学、中医内科学、中医儿科学、中医妇科学、针灸学、腧穴学、中医外科学、中医伤科学、中西医结合妇科学、急诊学
省级精品视频公开课（2个）：方剂学、中医妇科学 2014年7月学院官网显示，学院拥有省部级重点学科28个,其中国家中医药管理局重点学科17个，云南省重点学科9个、优势特色重点学科2个、“十二五”立项建设博士学位授权一级学科2个。4个一级学科硕士学位授权点。
中国家中医药管理局重点学科（17个）： 学科名称 所属二级学院 批准时间 学科名称 所属二级学院 批准时间 中医老年病学临床医学院2012.09傣医学民族医药学院2009.11中医儿科学2012.09临床中药学中药学院2009.11推拿学2012.09中医管理学——中医药对外合作管理学临床医学院 2012.09中医耳鼻喉科学2012.09国际教育学院中医预防医学2012.09中医文化学基础医学院2012.09中医痹病学2009.11思政部中医肾病学2009.11人文管理学院彝药学药学院2012.09中医心理学基础医学院2012.09中医男科学2011.09中西医结合基础2012.09中医人类学图书馆2012.09傣药学民族医药学院2012.09省重点学科（9个）：
中西医结合、药学、中西医结合基础、民族医学、针灸学、中医内科学、中医基础理论、临床中药学、实用中药学
一级学科硕士学位授权点（4个）：
基础医学、食品科学与工程、汉语国际教育、公共管理 2014年7月学院官网显示，学院拥有2所直属附属医院，8所非直属附属医院，实习医院33所，高等医学教育临床教学基地11个所组成的医学类实践教学基地。依托规模较大、技术力量较强的医药企业、科研院所和植物资源保护区，建立了稳定的中药学类、药学类和营销类专业实践教学基地50余个，形成了数量充足、结构布局合理的多层次、多功能，能满足学校开办专业、确保教学质量的实践教学基地。
附属医院分别是云南中医学院第一附属医院云南省中医医院、云南中医学院第二附属医院（筹）、云南中医学院第三附属医院昆明市中医医院、云南中医学院第四附属医院玉溪市中医医院、云南中医学院第五附属医院楚雄州中医院云南省彝医医院、云南中医学院第六附属医院西双版纳傣族自治州傣医医院、云南中医学院附属医院曲靖市中医医院 、云南中医学院附属医院昭通市中医医院 、云南中医学院附属医院开远市人民医院 、云南中医学院附属医院文山州中医医院 。
其中，第一附属医院是云南省唯一省级中医医院，是由省内90家州、市、县中医院组成的云南省中医医疗集团的总医院；第三附属医院是全国示范中医医院；第五附属医院是全国唯一的彝医医院；第六附属医院是全国唯一的傣医医院。
云南中医学院第二附属医院征地120亩随学院一同入驻呈贡大学城，将建设成为现代新昆明呈贡新区一流的，集教学、医疗服务、预防、保健、康复、科学研究、保健养生等功能于一体的中西医结合综合性三级甲等医院。
