西南大学音乐学院下设音乐教育系、音乐学系、音乐表演系和舞蹈学系共四个本科专业，含声乐、钢琴、理论、器乐、舞蹈等五个教研室。同时招收音乐心理学、中国古代音乐（教育）史、宗教音乐理论研究、民族音乐教学与研究4个方向博士研究生和音乐审美心理、中国传统音乐、音乐史与文献、作曲技术理论、音乐教育理论与教学、音乐表演理论与实践6个方向硕士研究生。
学院现拥有重庆青年交响乐团、交响管乐团、民族音乐合唱团、民乐团和舞蹈团等五个艺术实践平台。自2005年迄今，学院交响乐团、民乐团连年担任教育部“高雅艺术进校园”演出，被教育部授予“全国高校爱国主义经典艺术教育示范基地”，音乐表演“国家级特色专业”，音乐与舞蹈学“重庆市重点（一级）学科”。