中华人民共和国国务院的最高领导机构由总理主持，总理的正式名称为中华人民共和国国务院总理，其历史渊源可追溯至1949年至1954年的政务院总理。自1982年起，总理任期为五年，且连续任职不得超过两届。总理的主要职责包括召集和主持国务院常务会议和全体会议，按照宪法赋予国务院的职权进行操作。国务院总理在中国公务员体系中位于最高级别，属于正国级职位。
尽管近两任总理在中共中央政治局的排名中低于全国人大常委会委员长，但他们在国家政治中的影响力不容忽视。自国务院总理制度设立以来，这一职位一直由中共中央政治局常委担任。国务院的重要组成人员还包括副总理，他们是国务院常务会议的成员，对国家政策的制定和执行发挥关键作用。
国务院还设有国务院委员，这一职位自1982年增设以来，也作为国务院常务会议的成员参与决策。国务院秘书长是国务院的组成人员之一，负责处理国务院的日常事务，并领导国务院办公厅的工作，通常设有副秘书长协助其工作。
国务院常务会议是中华人民共和国国务院现行的法定会议之一，由总理、副总理、国务委员、国务院秘书长组成，由总理召集和主持。讨论决定国务院工作中的重大问题。一般每周召开一次。根据需要可安排有关部门、单位负责人列席会议。