城镇土地使用税提供了一系列税收优惠措施，主要分为两大类：国家预算收支单位的自用地免税和国有重点扶植项目的免税。
首先，对于国家机关、人民团体、军队，以及由国家财政部门拨付事业经费的单位，其自用土地通常免税。宗教寺庙、公园和名胜古迹的自用土地免税，但用于经营的部分则需要缴税。公共设施如市政街闭道、广场和绿化地带的用地也属于免税范围，但直接用于农业生产的是免税的。
对于特定的整治土地和改造废弃土地，经批准后在使用初期（5年至10年）可以免税。非营利性医疗机构、疾病控制机构和妇幼保健机构的自用土地免征城镇土地使用税，而营利性医疗机构自2000年起有3年的免税期。企业办的学校、医院、托儿所和幼儿园，只要其用地能与企业其他用地明确区分，也可享受免税待遇。
在土地使用上，如果免税单位无偿使用纳税单位的土地，免税单位无需缴税，但反之则需纳税单位缴税。对于共同使用的多层建筑，按占用比例计征税款。例如，一栋15层的大厦，一家租用5层，另一家租用10层，各自按比例缴税。
最后，行使国家行政管理职能的中国人民银行总行（含国家外汇管理局）所属分支机构的自用土地，也免征城镇土地使用税。
城镇土地使用税是以开征范围的土地为征税对象，以实际占用的土地面积为计税标准，按规定税额对拥有土地使用权的单位和个人征收的一种行为税。