公安县人民政府办公室的内设机构分工明确，以高效服务政府运行。其主要机构包括：
文秘科：负责组织县政府会议、日常事务管理，处理文件、文电及会议纪要的起草、核审，编写大事记，执行政务公开，档案管理和指导公文处理。
人事科：负责办公室机构编制、人事管理，目标责任制、干部培训、计划生育及纪检工作，以及挂靠单位的人事事务。
行政科：负责领导活动安排、接待工作和工会、老干部管理，同时管理财务和车辆。
一科（工业科）：聚焦工业经济、信息化等，负责相关文件起草、会务组织和督办检查，参与问题研究和协调。
二科（农业科）：关注农业、农村等领域，负责起草相关文件、组织会务，参与问题处理并联系县科协。
三科（财税科）：处理财政、编制等事务，起草相关材料，进行会务组织和督办检查。
四科（教卫科）：涉及教育、卫生等领域，起草文件、组织会务，参与问题研究和协调，联系县文联。
五科（发展建设科）：负责发展改革、住房等多领域工作，组织文件处理，会务和督办检查。
调研信息科：负责政府调研，政务信息编发，完成领导布置的调研任务。
文字综合科：负责起草政府工作报告、领导讲话和综合性汇报材料，编发政情通报。
政务督查室：负责政府文件、会议决定事项的督查落实，人大、政协建议、议案的办理和督查。
应急办（总值班室）：负责应急管理工作，处理突发事件，处理群众来信来访，协助领导处理重大事件。
金融办公室：负责金融、保险领域的文件处理和会务组织。
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