卵巢有多重要自然是不用说了，它不但控制着女性的性腺激素的分泌，同时关系到生殖器官的发育问题，一旦卵巢出现问题，例如感染、炎症、肿瘤等等都会直接影响到女性生育，那么卵巢巧克力囊肿根治是切除卵巢吗?
不一定是切除卵巢，有多种治疗方法，需要根据患者的具体情况来定。不同患者采取治疗手术方式不一样：
1、确诊后宜立即手术，因流出的囊液可引起盆腔粘连、不育或异位内膜的再次播散和种植。
2、年轻未生育者在吸引和彻底冲洗吸引溢入盆腔内的囊液后，做囊肿剥出术，尽量保存正常卵巢组织，对维持卵巢功能和内分泌功能有助，对日后增加孕育机会也有助。
3、双侧卵巢受累，原则上也尽量做囊肿剥出术，若囊肿与周围组织粘连紧密，强行剥出易损伤脏器时，则可用无水酒精涂在囊腔内，使囊腔内上皮层坏死，以免日后复发，术后仍宜用药物治疗。
4、对年龄较大且已有子女对侧卵巢正常、子宫无受累者为避免日后复发，也可考虑作患侧附件切除。
5、卵巢巧克力囊肿破裂者手术时宜彻底清洗腹腔，尽量切除病灶，松解粘连。
6、术后一般仍宜服用治疗子宫内膜异位症的药物，以防止肉眼未能检出的病灶或囊液污染腹腔引起新的播散和种植病灶的产生。
卵巢是女性的重要器官，不到迫不得已的情况下医生是不会将卵巢给切除，因此患有巧克力囊肿的人不用太过恐慌。具体自己的巧克力囊肿该用哪种方式进行治疗，是手术还是药物还是其他的方式，应该要通过检查来进一步的确定。
巧克力囊肿是可以根治，但是它根治的这个是有前提的，在女性绝经之后，体内雌激素孕激素水平降低，那这个卵巢囊肿的也会消失或者是减少，巧克力囊肿为子宫内膜异位到卵巢形成的囊肿。可以口服抑制雌激素的药物治疗，如孕激素，达那唑，保守治疗无效的情况下可以考虑手术，首选腹腔镜手术。
一般的巧克力囊肿微创手术是由专业手术医生在腹腔镜下，切几毫米的小口，取出囊肿组织。手术伤口小、出血也少，患者术后恢复也很加快。腹腔镜的问世，是巧克力囊肿患者乃至很多肌瘤等需进行妇科手术患者的福音。不用切除卵巢和子宫，这才能保证女性的完整性，很多女性在切除子宫卵巢之后，虽然疾病是得到了有效的治疗，但是身体器官少了，身体机能素质是会得到下降的。不到万不得已且十分危急的情况，现在医生都不会告知需要切除患者的卵巢或者子宫的。