“府”最大由中央政府直接派遣官吏治理，官名—知府。往下依次为“州”和“县”。
清沿袭明制，大致分省、府、县三级，总督、巡抚为掌握行政、军事、监察大权的高级地方官员，布政、按察两使为督、抚的属官。
与督、抚平行的有驻防将军和提督学政，不过驻防将军只管八旗驻军；提督学政只管学校与科举考试，其权力不能与督、抚相比的。
省以下有道的设置，道为监察区性质，不算正式行政区。道主要有分守道和分巡道两种，兼兵备衔，另有一些不属布政、按察二司的道，如海关道、管河道、督粮道、盐法道等。省以下为府，设知府、同知、通判等官，与府平行的有直隶厅，设同知、通判。
府以下为县，设知县、县丞、主簿等官，与县平行的为散厅，设置同直隶厅。
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清朝的行政区划：
在行省设置方面，基本沿袭了明代所置的两京与十三布政使司，即南北二京及山东、山西、河南、陕西、浙江、福建、江西、广东、广西、湖广、四川、云南、贵州。1644年（顺治元年）定鼎北京，以盛京为留都 。
1645年（顺治二年）改北直隶为直隶省，改南直隶为江南省。1664年（康熙三年），分湖广为湖北、湖南二省。
1667年（康熙六年），江南省正式分为江苏、安徽二省。1668年（康熙七年），陕西省正式分为陕西、甘肃二省，自此形成了所谓「内地十八省」的格局。分别为直隶、江苏、安徽、山西、山东、河南、陕西、甘肃、浙江、江西、湖北、湖南、四川、福建、广东、广西、云南、贵州。
1885年（光绪十一年），分福建省台湾府置“福建台湾省”。两年后台湾正式建省，正式称「福建台湾省」。1895年（光绪二十一年），因甲午战争战败，台湾省被割让予日本，遂被废除。
1905年1月（光绪三十年十二月），分江苏江宁、淮安、扬州、徐州四府及通州、海州二直隶州置江淮省，旋即裁撤，仍为江苏省。此後至清末，内地仍为十八省，与东三省、新疆省合为二十二省。
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