荣独山1901年12月18日生于江苏省无锡县荣巷镇。
小时候就读于荣巷镇公益小学。
1915年考入上海华童公学，
1918年后转入圣约翰大学中学部。
1919年春因参加爱国运动而被迫退学，改人复旦大学附属中学。
1920年9月考取北京协和医学院预科。在医预科读书期间，曾参加反对英国在沪的暴行运动。他又酷爱文艺体育活动，喜打网球，擅长京剧。曾与同学林巧稚演过英语话剧《哑妻》等，获得好评，但当时北京协和医学院的考核要求极为严格，他为此而耽误了部分学习。个别医学院教授曾戏称，如果他改行学文艺，必能出人头地。 1929年在北京协和医学院毕业，获得美国纽约州立大学医学博士学位。毕业后留协和医院任放射科住院医师。他工作积极努力，善于思考，不断研究、改进工作。并经常参加各科查房，与临床医师讨论解决疑难病例的诊断问题，深得各科教授的赞赏和信任。在谢志光主任于1932年出国期间，他能独立担任放射科的全面工作。
1933年10月被学校派送到美国圣路易市华盛顿大学医学院Mallinckrodt放射研究所，随Sherwood Moore教授进修放射诊断。该医学院附属的Barnes医院同时聘任他为临床助教，参加医院内日常的X射线诊断工作。因为当时他进修的课题之一为国内最常见的疾病肺结核，他又特地到纽约市康耐尔（Cornell）大学医学院随病理科Eugene Opie教授学习肺结核病理四个月。1934年12月学成回国，继续在协和医院工作，任放射科主治医师。 1935年晋升为讲师。
1936年5月应国民政府卫生部的邀请，任南京中央医院放射科主任。八一三事变后，参加了红十字会组织的救护大队。他一面制定捐购X线机的计划，一面主持训练X线技师，还亲自至各医院为伤员作透视和摄片检查。抗日战争中，南京危急，中央医院奉命撤退时，他主持留守工作，直至南京沦陷前夕方随部队撤离。
1937年11月到达长沙，12月去汉口参加中国红十字会总队部，任X光队队长，后任医务股主任及代理总队长等职。
1938年夏救护总队部在长沙曾组织4个医疗队携带医疗用品和器材，包括轻便X线机，分赴陕北和山西工作。其中一台X线机装在延安山涧中应用。救护总队部还拨给新四军不少药品器材，并为白求恩在陕北设立的和平医院运送器材。后救护总队经祁阳至贵阳图云关。
1942年，他辞去救护总队部职务，任战时卫生人员训练所附属陆军医院医务主任。他在贵阳图云关期间曾开办x线技术员和放射科医师训练班，培养基层工作人员。同时为贵阳医学院、湘雅医学院以及成都联合医学院讲授X线诊断学课程，直至抗战胜利。
1946年他作为随军训练团工作人员，再度被派往美国，在密苏里州立肿瘤医院随放射治疗专家JuanA．DelRe－gato教授进修放射治疗。他参加该院的日常放射治疗工作，进行肿瘤病人的随访检查，并和各科专家作病例讨论。
1947年冬回国，继续任国防医学院放射科主任、教授，同时兼同济医学院教授。1949年初国防医学院决定全院迁往台湾，要求荣独山同去，并代为购买飞机票，但被他拒绝。他于1949年7月离职。
1949年9月他同夫人林飞卿教授一起参加上海医学院的工作，任放射学教研室主任，兼附属中山医院放射科主任。
1956年被评为一级教授。
文化大革命期间因历史问题受到隔离审查。
1972年回科室任一般医师工作，他恢复工作后依然认真负责，主动要求退居二线。积极培养中青年医师，并著书立说。
