1466年（明成化二年），明朝太监王定因母病，便在武昌蛇山南麓开出一方净土，明宪宗朱见深御赐匾额龙华寺 。因此，本寺是“孝道”的作品。
1477年（明成化十三年），龙华寺扩建。
1500年（清弘治十三年），龙华寺再次扩建。
1502年（清弘治十五年），该寺有佛殿五座，观音殿、天王殿、山门各三座，钟楼一座，东西廊舍48间，总共有264楹。佛殿巍峨，宝相庄严，桥梁镂刻，柏竹丛绕，终成为一大丛林。清顺治、光绪年间又数次重修该寺，使其成为武昌城内大型寺院之一。
1749年（乾隆十四年）或稍前，清代吴敬梓作《儒林外史》以抄本传世，第三十八回《丫姑爷乘龙充快婿 知客僧拉马认干娘》中这样描述：且说这武昌省城有名是一座龙华寺。这龙华寺坐落在宾阳门（今大东门）内，乃是个极大丛林，听说亦有千几百年的香火了。
1919年（民国八年），五月、太虚大师讲起信论于武昌龙华寺，印行起信论别说。
1954—1958年，武昌尼众响应政府号召，开展生产自救，龙华寺的大和尚将此庙舍给72座小庙集中而来的172位比丘尼。白天在外生产，晚上回寺过宗教生活。
1979年，党的十一届三中全会以后，落实宗教政策，龙华寺收回被占房产和土地，当时房屋土地面积仍是6000多平米，居住尼众一百多人。
1994年，有人受经济利益驱动，为一己私利，不顾我国的宗教政策，擅自拆毁了龙华寺的山门楼、清代木结构的天王殿、明代的海岛以及尼众住房，改造成商业楼和居民楼。
2007年，随着蛇山“显山透绿”工程加速，一座有着540多年历史的寺院——龙华寺重新“露脸”。
2008年，在武昌“两轴五片筑名城”的规划中说，要营造蛇山自然生态板块“寻幽访绿、层楼叠嶂”的意境，重点修复自然山体、恢复山林植被，营造自然生态、优化观赏游线，建设野趣盎然、人文荟萃的城市森林，保留龙华寺寺庙功能，营造“深山藏古寺”的意境。
2011年，龙华寺大规模扩建，全面恢复了寺院当年的面貌。
2013年10月20日清晨七时许，武昌龙华寺为著名女书法家翁月卿女居士做超荐法事，空灵的梵呗声穿过茂林修竹，袅袅飘散在蜿蜒的蛇山脚下。
