木霉菌依不同作物种类与作物不同时期有不同的使用方式，主要是要让木霉菌均匀分布于植物根部、表面与土壤中，短期作物使用1-2次，果树花卉等多年生作物每年使用3-4次即可，木霉菌使用次数越多效果越明显，长期使用可有效减少土壤传播性病害发生，多用有益无害。木霉菌使用时常添加米糠或豆粕以增加田间木霉菌增殖的能量也方便木霉菌在田间的分散性，使用量约为木霉菌之20-40倍。 作物种类 使用方式 建议用量 施用方式 水稻 分蘖盛期与抽穗期各使用一次 每分地/0.5kg 喷洒 叶菜类 播种（或种苗）及叶片交叠初期各使用一次 每分地/2kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 花卉及观叶植物 每月使用一次，连续3次 每分地/2kg 喷洒、灌注、堆肥 茄科或小黄瓜 每月使用一次，连续3次 1000株/1kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 苦瓜与丝瓜 每月使用一次，连续3次 200株/1kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 槟榔 每月使用一次，连续3次 1000株/1kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 果树 每月使用一次，连续3次 100株/1kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 草皮 每月使用一次，连续3次 每分地/2kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 球根与块茎类 每月使用一次，连续3次 种块1000kg/1kg 浸泡、喷洒、灌注、混拌、堆肥 草莓 每月使用一次，连续3次 2000株/1kg 喷洒、灌注、混拌、堆肥 种子处理：
种子拌种：每公斤种子直接混合100克木霉菌粉剂用于直播（种子先浸水并马上甩去多余水份并添加木霉菌粉剂混合后直播）。
种苗、种薯与块茎处理：
插穗：插穗以木霉菌300-500倍稀释液浸泡后直接扦插。
苗栽：以木霉菌300-500倍稀释液整株浸泡后直接种植。
球根与块茎：以木霉菌300-500倍稀释浸泡种后直接种植。
表面喷洒
叶部喷洒：请以木霉菌粉剂500-1000倍喷施。
土壤或有机质肥料表面：请以木霉菌粉剂500-1000倍喷施于有机质或土壤表面。
介质与土壤处理
（一）混拌：
方法（1）
1、1份的木霉菌粉剂添加20份的米糠混合均匀（放大使用）。
2、将1000份的介质（或有机质肥料）与上述材料再次混合并添加少量的水（维持少量湿度）。
3、露天堆放7天可使用（不可以用不透气的袋子覆盖以免产生阿摩尼亚毒害木霉菌）。
方法（2）
1、1份的木霉菌粉粒剂添加于200-500份的介质（或有机质肥料）混合均匀。
2、直接用于育苗或田间。
（二）灌注：以木霉菌粉剂500-1000倍灌注于土中或介质中。
