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R语言做出的的pca的得分如何导出为Excel?
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使用
R语言
对SSR数据做主成分分析(
PCA
)的一个简单小例子
答:
使用到的
是R语言的
poppr 包中的 read.genalex() 函数 poppr 第一次使用需要先安装 读入数据 读入数据直接是 genclone object,使用函数 genclone2genind() 将其转换成genind object,接下来使用 ade4 包中的 dudi.
pca
() 函数做主成分分析 主成分的结果存储在li中 还是认为的分个组,然后做散点...
R语言PCA
降维后
怎么
恢复原数据
答:
你先把原数据保存了,然后pca降维呀,原始数据仍然还在那儿呀。prcomp(formula, data = NULL, subset, na.action, ...)predict(object, newdata, ...)还有 stats::princomp 都
是pca的
方法。
PCA得分
图的置信椭圆
如何
有两个
答:
1、可以使用
R语言为PCA
散点图加置信区间的方法,拿一组数据集为例,
PCA得分
图的置信椭圆使用R中的prcomp基础函数完成主成分分析。2、然后使用ggplot2可视化,提取不同记录
的PC
1-PC8数值,即点的横纵坐标值就能得到两个椭圆。
《
R语言
实战》自学笔记71-主成分和因子分析
答:
(7)计算主成分或因子
得分
。
PCA的
目标是用一组较少的不相关变量代替大量相关变量,同时尽可能保留初始变量的信息,这些推导所得的变量称为主成分,它们是观测变量的线性组合。如第一主成分为: 它是k个观测变量的加权组合,对初始变量集的方差解释性最大。第二主成分也是初始变量的线性组合,对方差的解释性排第二,同...
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