内海、领海和毗连区主要从概念、范围、法律地位和享有权利来区别。
一、概念不同
内海：内海是指一国领海基线以内的一切水域。
领海：领海是沿海国陆地及其内海以外邻接的处于其主权之下的一带海域。
毗邻区：毗邻区是领海以外邻接领海，沿海国在其中对其特定事项行使必要管制的一带海域。
二、范围不同
内海：内海范围是领海基线以内。
领海：领海范围是不超过领海基线外12海里。
毗邻区：毗邻区是从领海基线量起，不得超过24海里。
三、法律地位不同
内海：内海是国家领土的一部分，国家对其拥有完全的、排他的主权。
领海：领海属于国家领土，沿海国对其享有主权，及于领海上空、海床、底图。
毗邻区：毗邻区不是国家领土，国家不享有主权，只在其范围内行使特定管制，但不包括毗邻区上空。
四、享受权利不同
内海：沿海国主权管辖部分，外国船舶和飞机非经许可不得进入。
领海：沿海国享有自然资源所有权和专属管辖权、海上航行和空中飞行管辖权、海洋科学研究专属权、海洋环境保护和保全管辖权、国防保卫权。
毗邻区：沿海国可行使海关、财政、移民、卫生等行政管辖权力。