新乐市水务局内设机构及其职能清晰明确，确保了各项工作的高效运行。以下是各部门的主要职责：
1. 办公室：负责局内文件的起草、打印与管理，包括档案整理、统计、劳资政工、机关事务、计划生育、综合治理、信访及各部门协调等工作，同时接受石家庄市水利局劳动人事处和办公室的指导。督查室作为其下属部门，负责对各科室站的工作进行监督检查。
2. 财务科：专司全局财务管理，负责资金调配、收费统计、工程项目资金监督以及河道采砂管理费协调，执行石家庄市水利局财务处和发展计划处的指令。
3. 农村水利管理科：致力于农村饮水安全和农田水利设施，应对防汛抗旱与闸桥建设，配合上级相关处室的工作。
4. 河道管理办公室：负责河道和排水设施的管理，包括报表统计、河道采砂、案件监察等，并对涉及设施的工程审批和收费进行管理，接收石家庄市河道办公室的工作安排。
5. 水政执法监察大队：主要负责全局的水事执法，维护秩序，包括巡查自备井、打击非法行为，以及在各类水务工作中处理案件。
6. 市区收费站：主要征收供水公司集中供水区域的河道费和自备井相关费用，以及特定区域建筑业的收费。
7. 长寿水利工作站：位于长寿街道办等地，负责水利工程管理、水事案件处理、防汛抗旱及特定区域的收费征收，接受业务科室指导。
8. 承安水利工作站：作为水务局的派出机构，全面负责承安区的水务工作，涵盖水利工程管理、收费征收等，并协调南水北调基金的征收。
9. 邯邰水利工作站：同样为派出机构，负责邯邰区的水务全面工作，包括水利工程管理、收费征收、乡镇南水北调基金征收等。