南昌市文学艺术界联合会的组织机构设有多个职能部门，以确保其高效运行。首先，办公室承担着关键的职责，它负责文联内外的沟通与综合协调，确保重大活动和重要会议的顺利进行。该部门还负责文联内部的行政管理工作，包括文秘、人事、财务、宣传、纪检、老干、后勤和保卫事务。
在艺术创作方面，文学艺术部扮演着重要角色。它致力于宣传党的文艺方针和政策，组织各类文艺家开展采风活动，推动作家、美术家、摄影家等十二个协会的创作活动。该部门致力于促进文艺创作和理论研究，通过评选、奖励和表彰优秀文艺成果，培养和扶持文艺人才，壮大和发展文艺队伍。同时，它还指导和协调县（区）、厂（矿）的文艺协会工作。
组联部则负责与省市文联，以及各文艺协会、全市文艺协会、地方文联、企业文联和外地市文联的联络与协调，确保文联与各地的紧密联系。此外，它还负责对外文化交流的联络工作，组织文化产业研讨活动，推动跨地区、跨领域的文化交流与合作。
南昌市文联是中国共产党南昌市委员会领导的，全市各文学艺术家协会、各县（区）文联和各企业文联、各行业文联、文艺社团所组成的人民团体，是江西省文联的团体会员；是党和政府联系文艺家的桥梁和纽带；是繁荣社会主义文艺，发展社会主义先进文化的重要力量；是团结文学艺术各类专门人才、又广泛联系业余文艺爱好者的多层次的文艺团体。