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扩增子建库
在二代测序中,捕获法和
扩增子
法,这两种
建库
方式有什么各自
答:
对于已知的融合或病毒整合,
扩增子
法同样适用于检测。在实验时间方面,捕获法通常比扩增子法耗时更长。然而,使用转座
子建库
/酶切打断建库+2h快速杂交的技术方案,可以在8-12小时内完成从DNA到上机文库的制备。尽管快速杂交技术方案存在杂交不充分的问题,导致产物浓度变低、均一性变差,但捕获的特异性通...
技术介绍 | MGI测序原理
答:
文库构建,DNA的个性化身份证 客户提供的DNA样本需要经过精心处理,形成独特的“文库”,这是测序的起点。DNA片段化是基础步骤,通过机械或酶切技术将其切成200-500bp的小片段。根据测序需求,如PE150测序,DNA片段应保持在420bp的理想长度。
扩增子建库
和cfDNA则根据目标调整,无需片段化。接头添加是赋...
二代测序中Duplication问题讨论
答:
DNA多样性和PCR扩增环节是关键因素,通常建议duplication比例保持在15%以下,除非特殊情况,如
扩增子
测序。Duplication的产生涉及样本制备过程:首先,核酸打断成小片段,原始拷贝多,打断后几乎无duplication。然而,片段越短,PCR扩增越频繁,可能导致duplication率上升。文库构建和PCR扩增阶段,adapters的添加及多...
多重PCR技术知多少
答:
翼和生物技术顾问肖君华博士介绍,该公司的多重PCR技术,均一性高,90%
扩增子
达到15个reads以上;特异性高,90%的靶序列均能被有效扩增,结合该技术的
建库
试剂盒适用于当前各类高通量测序仪器的富集文库构建,包括PGM,Miseq,Hiseq各类机型和试剂盒。"我们的多重PCR技术已使用于基于高通量平台的各类技术...
如何快速、准确的检测CRISPR编辑效率?
答:
而高通量测序技术如
扩增子
和GUIDE-seq则更为精准和高效。扩增子测序能定量分析突变频率,尤其对低频突变敏感;GUIDE-seq则同时检测靶向和脱靶位点,提供更全面的编辑效率数据。珠海舒桐科技凭借Illumina/MGI平台、丰富的
建库
经验和专业团队,提供快速、准确的基因编辑检测服务。其优势包括:检测范围广泛,能同时...
二代测序文库构建-概述与挑战(1)
答:
DNA样本的文库制备,不管是用于WGS、WES、ChIP-seq还是PCR
扩增子
,一般都遵循相同的流程。总的来说,对于任何应用,目标都是使文库尽可能的复杂。 DNA
建库
试剂盒目前有多个品牌。竞争也促使价格迅速下降以及质量的提升。这些试剂盒能够处理DNA起始量从ug到pg多个级别。但是,我们需要记住一点,起始量大可以降低扩增循环数,因...
Duplicated Reads
答:
极端的例子就是
扩增子
(PCR产物)测序,dup rate可以很高,但完全没有探针存在。探针杂交过程中最影响分子多样性的因素是探针分子与目标分子的比例,其次是杂交的时间。探针与目标分子的比例最低应该在100:1(一定的体积内,有体积的要求),高于这个比例,探针是能够将目标分子捕获的。目前的探针法NGS,这个比例是很高的,探针...
一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点分别是什么,求大神赐教
答:
二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是序列读长方面比第一代测序技术要短很多。三代测序优点是读长较长,可以减少拼接成本,节省内存和计算时间。缺点是单读长的错误率偏高,需重复测序以纠错(增加测序成本)...
简化甲基化测序和甲基化测序的区别
答:
目前表观遗传学DNA甲基化研究测序方法常见的有:全基因组重亚硫酸盐甲基化测序[WGBS]、精准DNA甲基化和羟甲基化测序[oxBS-seq]、优化版简化甲基化测序[RRBS/dRRBS/XRBS]、单/微量细胞全基因组甲基化测序[scWGBS]、
扩增子
(羟)甲基化测序、(羟)甲基化DNA免疫共沉淀测序[(h)MeDIP-seq]等6种,适用于不同DNA...
NGS011 靶向测序方法分类
答:
多重
扩增子
测序即针对感兴趣的目标区域,设计多重PCR引物进行扩增富集并进行测序的技术。通常适用于检测几十到几千个位点,或几十kb以下的区域。分子倒置探针(MIP)技术其原理是设计一个口袋状探针,探针结构如图所示,H1和H2能和目标区段退火,然后利用DNA聚合酶将探针缺口补齐,同时添加DNA连接酶,将缺口...
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