1、革兰氏染色后颜色不同：枯草芽孢杆菌是革兰氏阳性菌，染色后为紫色，大肠杆菌是阴性，染色后是红色。
2、菌体大小不同：枯草芽孢杆菌菌体较大，大肠杆菌菌体很小。
3、芽孢不同：枯草芽孢杆菌会形成芽孢，大肠杆菌不形成芽孢。
扩展资料
1、枯草芽孢杆菌可利用蛋白质、多种糖及淀粉，分解色氨酸形成吲哚。在遗传学研究中应用广泛，对此菌的嘌呤核苷酸的合成途径与其调节机制研究较清楚。广泛分布在土壤及腐败的有机物中，易在枯草浸汁中繁殖。
2、枯草芽孢杆菌菌体生长过程中产生的枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质，这些活性物质对致病菌或内源性感染的条件致病菌有明显的抑制作用。枯草芽孢杆菌迅速消耗肠道中的游离氧，造成肠道低氧，促进有益厌氧菌生长，间接抑制其它致病菌生长。
3、刺激动物（人体）免疫器官的生长发育，激活T、B淋巴细胞，提高免疫球蛋白和抗体水平，增强细胞免疫和体液免疫功能，提高群体免疫力。枯草芽孢杆菌菌体自身合成α-淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶等酶类，在消化道中与动物体（人体）内的消化酶类一同发挥作用。
4、能合成维生素B1、B2、B6、烟酸等多种B族维生素，提高动物体（人体）内干扰素和巨噬细胞的活性。
5、 枯草芽孢杆菌对特殊菌体进行促芽孢和微胶囊包被处理，在芽孢状态下稳定性好，能耐氧化；耐挤压；耐高温，能长期耐60°C高温，在120°C温度下能存活20分钟；耐酸碱，在酸性胃环境中能保持活性，可以耐唾液和胆汁的攻击，是微生物中可100%直达大小肠的活菌。
5、动物的大肠杆菌病可以发生在多种家畜、家禽、养殖经济动物以及其他陆生动物和某些水产动物，其中猪和鸡是最为易感的，而且危害十分严重。
6、大肠杆菌在动物群体间的感染的季节发病特征不是非常明显。在一年四季猪均可发生，但只要是发生在猪的产仔期至断乳期，这与猪的易感日龄相关联。犊牛和羔羊多发生于冬季和春季。其他动物的大肠杆菌感染在常年均有发生，季节性不明显。
7、人的大肠杆菌病的主要传染源是因为在胃肠道感染患者的粪便中有大量大肠杆菌病原菌排至体外构成的。大肠杆菌在人之间的传播途径多是通过粪-口这一传播途径，在一定的条件下可引起大肠杆菌病散发或流行。
参考资料
2、镜检观察：枯草芽孢杆菌会形成芽孢，且菌体较大；而大肠杆菌不形成芽孢，菌体很小。本回答被提问者采纳