不孕不育的检查主要是由患者的就诊时间决定的。如果患者是在经期就诊的，那么患者可以做内分泌检查，可以查窦状卵泡的情况。如果是在经期之后就诊的，那么可以做阴道分泌物的检查，也可以做B超检查，然后做输卵管检查。从月经来潮时计算第八、九、十天可做排卵监测，不同的人根据自身月经周期来定，排卵监测有一个过程。而有些B超检查，比如子宫内膜的检查，可以放在月经来之前，若要做子宫内膜活检，一般需在月经来的前一天到月经来的12个小时内取样。还需要检查：卵巢功能检查：经期第二、三天一般是经期的第二天或第三天抽血检查荷尔蒙，因为在这时候，女性体内的荷尔蒙不会有太大的浮动，因此可以清楚判断卵巢老化、慢性不排卵及多囊性卵巢症状群等问题。泌乳激素检查：早上较好一般妇女泌乳激素如果过高，会干扰正常排卵及月经周期。由于泌乳激素在傍晚，尤其是在夜晚会生理性上升，因此建议在早上检查，比较准确。卵巢肿瘤指数检查：非经期较适合如选在经期间抽血检查卵巢肿瘤指数(Ca125)，大都呈现假阳性偏高，会让患者白白担心受怕，以为自己得了不治之症。因此建议最好在非经期期间检查。输卵管摄影：月经后三至七天输卵管摄影，是透过施打显影剂到子宫腔及输卵管中，来评估妇女输卵管通畅最常做的检查。千万不要在排卵期间检查，这会把受精卵推向输卵管末端或腹腔，造成子宫外孕;也不可在经期间执行检查，由于经血可能阻塞原本通畅的输卵管，造成误判。因此最佳的检查时间点为月经结束后的三至七天内。子宫镜检查和腹腔镜检查：月经后三至七天最适宜子宫镜必须灌水撑开子宫腔以利检查，而腹腔镜则是将显影剂注入子宫腔及输卵管，来判读输卵管是否阻塞，两者都有可能把胚胎冲走，造成外孕。因此最佳的检查时间点也是在月经结束后的三至七天内。
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