有营业执照签订三方协议原则上是可以的，但个体工商户没有组织机构代码证，也没有在当地人才中心办理人事代理的资格。因此即便在协议上盖章，但毕业生的就业报到证及就业手续都无法直接办理。
《民法典》第四百九十条当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
个体工商户也能签三方协议,但是要注意两点:
1.和应届毕业生签订三方协议原则上是可以的,但个体工商户没有组织机构代码证,也没有在当地人才中心办理人事代理的资格.因此即便在协议上盖章,但毕业生的就业报到证及就业手续都无法直接办理.
2.如果毕业生本身不介意,那当然是没什么关系,但是作为毕业生未来的老板,还是有义务把情况向毕业生说清楚,以免引起不必要的麻烦.
三方就业协议书是国家教育部统一印制的,主要是明确三方的基本情况及要求.三方就业协议书制定的依据是国家关于高校毕业生就业的法规和规定,有效期为:自签约日起至毕业生到用人单位报到止的这一段时间.而劳动合同是受《劳动法》和《合同法》的限定和保护,有些用人单位如许多外企在确定录用时(注:在到用人单位报到前),就同时要求和毕业生签订一份类似劳动合同的协议;而更多的用人单位则要求先签"就业意向书",毕业生报到后再签订劳动合同.
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第十一条
用人单位未在用工的同时订立书面劳动合同，与劳动者约定的劳动报酬不明确的，新招用的劳动者的劳动报酬按照集体合同规定的标准执行；没有集体合同或者集体合同未规定的，实行同工同酬。
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