1、性质不同：不动产证是房产证和土地使用权证书的合二为一。
2、防辐射标签：房产证没有防辐射标签，不动产证有防辐射标签。
3、内容不同：房产证外页只有中华人民共和国房屋所有产权证，并无其它内容。房产证内页内容包括房屋所有权人、共有情况、房屋坐落、登记时间、房屋性质、规划用途、房屋状况和土地状况。
法律依据:《《不动产登记暂行条例实施细则全文》 第二十五条 市、县人民政府可以根据情况对本行政区域内未登记的不动产，组织开展集体土地所有权、宅基地使用权、集体建设用地使用权、土地承包经营权的首次登记。
依照前款规定办理首次登记所需的权属来源、调查等登记材料，由人民政府有关部门组织获取。