工伤费用是不能按照农村合作医疗进行报销的，工伤费用应该由单位和工伤保险基金共同承担，员工是不用承担医疗费用的，工伤也不能由其他种类的保险报销，当然，如果没有工伤保险的，可以由个人购买的保险或者职工医疗保险负担一部分的费用。法律依据:《中华人民共和国社会保险法》第三十八条因工伤发生的下列费用，按照国家规定从工伤保险基金中支付:
(一)治疗工伤的医疗费用和康复费用;
(二)住院伙食补助费;
(三)到统筹地区以外就医的交通食宿费;
(四)安装配置伤残辅助器具所需费用;
(五)生活不能自理的，经劳动能力鉴定委员会确认的生活护理费;
(六)一次性伤残补助金和一至四级伤残职工按月领取的伤残津贴;
(七)终止或者解除劳动合同时，应当享受的一次性医疗补助金;
(八)因工死亡的，其遗属领取的丧葬补助金、供养亲属抚恤金和因工死亡补助金;
(九)劳动能力鉴定费。
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