核酸中核苷酸之间通过磷酸二酯键来连接，因为磷酸和含氮碱基分别位于五碳糖的第3位和第5位上。
脱氧核糖与磷酸之间连接的键为磷酸二酯键，其是一种化学基团，指一分子磷酸与两个醇（羟基）酯化形成的两个酯键。该酯键成了两个醇之间的桥梁。例如一个核苷的3ˊ羟基与另一个核苷的5ˊ羟基与同一分子磷酸酯化，就形成了一个磷酸二酯键。
磷酸二酯键的特点
DNA聚合酶，限制性内切酶，DNA连接酶都可作用于磷酸二酯键。和二个糖、醇等的羟基（R—OH， R′—OH）形成酯时的键为磷酸二酯键。代表性的磷酸二酯键是核酸的核苷酸间的键，由于相邻核苷酸的糖的3′－OH和5′－OH中磷酸分子脱氢，五碳糖脱去羟基而形成磷酸二酯键而聚合起来。此键可由酸、碱或酶的作用而水解。
以上内容参考：百度百科-磷酸二酯键
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