一、两者行政级别不同：
直辖市是国家的一级行政区、深圳是属于副省级市（计划单列市）、副省级市仍为省辖市，由所在省的省委、省政府领导。这些市的机构改革方案仍由所在省审批，同时抄报中编委备案。15市的经济管理权限有关规定执行。深圳属于广东省领导。其行政级别要比直辖市低。
计划单列市介绍：
享有省一级的经济管理权限的非省级行政中心副省级城市。计划单列市全称国家经济与社会发展计划单列市，是省级单位对所辖大城市下放部分经济管理权限的城市，但是，计划单列市仍保留省辖市的行政地位，继续接受省级行政机构的领导。
对省辖大城市的计划单列，计划单列内容主要是工农业生产、交通运输、邮电、固定资产投资、主要商品购销和分配调拨，能源及主要物资分配调拨、外贸进出口、地方定额外汇、劳动工资 、财政信贷、科学技术以及各项社会发展计划指标等。中国大陆改革开放初期的1980年代，一些市由于其特有的经济地位而被称为“计划单列市”，享有省一级的经济和社会管理权限。至2015年时，全国有5个计划单列市。
直辖市介绍：
直辖市是许多国家的最重要省级行政区，此名称主要被中国、朝鲜、韩国、越南等汉字文化圈国家所采用。字面意义，是直接由中央政府所管辖的建制城市。直辖市往往需要较多的居住人口，且通常在全国的政治、经济和文化等各方面上具有重要地位。该概念首先源自于1930年中华民国的《市组织法》，称为院辖市。
由于直辖市的定位特殊，中国直辖市的中共市委书记一般由中共中央政治局委员兼任。
扩展资料
副省级行政级别
级别确定
副省级市仍为省辖市，由所在省的省委、省政府领导。这些市的机构改革方案仍由所在省审批，同时抄报中编委备案。15市的经济管理权限有关规定执行。
根据中编发[1995]5号文，副省级市的市直机关的级别，比照国办发[1993]85号通知中部委管理的国家局的机构级别确定，即市直工作部门为副厅级，内设机构为处级。市直属机构的副局长并不是正处，而是增加了一个级别，叫（正处）副局级。
市辖区及其工作部门的级别，可比照市直机关相对应的关系确定。副省级城市的副区长也是正处（副局）级。区辖街道办是正处级。
市辖县和代管的县级市的级别仍为处级，其工作部门仍为科级。
干部管理
按中央组织部《关于广州等16城市干部管理范围问题的通知》（组通字[1994]28号）执行，即：
（一）市委书记、市人大常委会主任、市长、市政协主席职务列入《中共中央管理的干部职务名称表》，其职务任免由省委报中共中央审批。
（二）市委副书记、市委常委、市纪委书记、市人大常委会副主任、副市长、市政协副主席、市中级人民法院院长、市人民检察院检察长的职务任免报中央组织部备案。备案办法按组通字[1991]10号文件规定办理。市委组织部部长的职务任免，须事先征得中央组织部同意。其他干部管理范围的确定，由省委根据本省实际情况研究决定。
（三）市委、市纪委、市人大、市政府、市政协领导班子换届选举时，省委须将人事安排方案报中央组织部审核。
一、两者行政区地位不同：
直辖市是国家的最重要省级行政区、深圳是属于副省级市（计划单列市）、在行政架构级别上要比直辖市要低。
计划单列市是享有省一级的经济管理权限的非省级行政中心副省级城市。计划单列市全称国家经济与社会发展计划单列市，是省级单位对所辖大城市下放部分经济管理权限的城市，但是，计划单列市仍保留省辖市的行政地位，继续接受省级行政机构的领导。
三、两者主要领导人的级别不同：
直辖市的市委书记个人行政级别可以高至副国级、而深圳的市委书记是副省级。
副省级市介绍：
副省级市是中国行政架构为副省级建制的省辖市，正式施行于1994年2月25日，其前身为计划单列市，其党政机关主要领导干部行政级别为省部级副职。
副省级市的党委、政府机关主要领导的级别，即中共市委书记、市人大常委会主任、市长、政协主席职务列入《中共中央管理的干部职务名称表》，其职务任免由省委报中共中央审批。但是在行政区划类别上，副省级市仍然属于省辖市，由所在的省级行政区管辖。
中国现有15座副省级市：广州、武汉、哈尔滨、沈阳、成都、南京、西安、长春、济南、杭州、大连、青岛、深圳、厦门、宁波。其中深圳、大连、青岛、厦门、宁波是计划单列市，其它都是省会城市。
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直辖市介绍：
直辖市属于省级行政单位，是直属中央政府管理的省级行政单位。
中华人民共和国共有省、自治区、直辖市以及特别行政区4种省级行政单位，其中，共有4个直辖市：北京市、上海市、天津市、重庆市。
直辖市作为行政单位，在不同的国家有不同的定义。即使在中国，大陆的直辖市和台湾省的直辖市（“院辖市”）也不同。基本的定义是，一个普通的行政单位（详见特别行政区），面积可以小至一个人民政府、一个市、一个镇、甚至一个村。
本回答被网友采纳直辖市的行政地位高，法律地位低。
特区拥有可以抵触国务院法规的立法权限，而直辖市的法规不仅不能抵触国务院法规，还得遵守国务院法规的结束。
直辖市一把手基本可以上副国级级别官衔，这个包括副省级待遇的城市也都是不具备对比的。
而深圳是四个中央领导的城市之一，虽然不是直辖市,却也堪比直辖市，相对拥有的律法地位，使得深圳政治地位与两个直辖市相当，远高于其他两个直辖市，在总体的数据对比的情况下。
深圳有自己独立的立法权，但是深圳人大通过的法律不能和国家根本法律相抵触，深圳地方法律制定以后，要在国家那里备案。深圳通过的法律，只适用在深圳。