参考文献和尾注的区别主要体现在以下三个方面：
含义不同：尾注是一种对文本的补充说明，一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴，一般包含在论文的结尾处。
在文档中的位置不同：尾注由两个关联的部分组成，包括注释引用标记和其对应的注释文本。注释引用标记是用于标明需要解释或补充说明的词语，通常出现在文中需要解释或补充的位置；注释文本是对引用标记的解释或补充说明，通常出现在页面的底部或文档的最后。参考文献通常位于论文的结尾处，以列表的形式列出。
组成部分不同：尾注主要分为两类，包括文档的尾注和节的尾注，都是用来对文档内容进行补充说明的。参考文献则通常由多个部分组成，包括序号、文献名称、作者、出版信息等。
总的来说，尾注和参考文献在含义、在文档中的位置以及组成部分方面都有明显的区别。虽然都是对文本的补充说明或参考借鉴，但是它们在格式和用法上有所不同。
此外，参考文献和尾注在学术论文中的作用也不同。参考文献是作者在撰写论文时所引用的其他文献资源的列表，用于证明作者的研究工作的可靠性和权威性。而尾注主要用于对文中的某些词语或内容进行解释或补充说明，帮助读者更好地理解文章内容。
毕业论文使用的是尾注，尾注和参考文献的区别在于所属领域不同：尾注是属于格式上的划分，参考文献是论文内容上的划分。
本科论文格式要看每个学校的具体要求。
一般来说脚注尾注都能用到。论文注释按照注释放置的位置可以分为当页脚注和参考文献。当页页下的脚注就是在该页面对本页文中引用的文献资料进行注释，而参考文献就是把所有的参考文献放在论文的最末尾，单独作为一个部分。参考文献是用尾注的。
参考文献是引用人家已发表的观点或者文章或者实验结果等,需要在引用的那段话后面加[1][2]这样的上标,然后文章末尾列“参考文献”时与文中的上标相对应。