滴虫病的病原是阴道毛滴虫、人毛滴虫和口腔毛滴虫，它们分别在人体的泌尿生殖道、肠道和口腔内寄生，引起这些部位的疾病。
在妇女的阴道、尿道内和男性的尿道、前列腺内有阴道毛滴虫寄生。它在体外的环境中有比较强的生存力，32～37℃是它最适宜的温度，在半干燥的环境下可生存14～20小时，在-10℃时还能活7小时，在46℃左右时能活20～60分钟，在普通的肥皂水中（浓度为0.06%）能活45～50分钟，所以它感染后不易被灭活。
人毛滴虫也称肠毛滴虫，虫体对消化液有一定的抵抗力，在不适宜的环境中可以形成假包囊。滋养体对外界也有一定的抵抗力，在粪便中（室温时）能生存8天，在土壤中能生存7天。滋养体主要寄生在人体的结肠内。
口腔毛滴虫滋养体在口腔内寄生，在齿垢及龋齿的蛀穴内定居。滋养体的抵抗力相当强，在室温下可以生存3～6天，在水中能生存10～12小时。