含山县环境保护局部门职能概述：
1. 办公室: 负责起草年度工作计划、总结等文稿，传达上级精神和组织学习。承担会议记录，处理机关行政事务，包括文电、档案、信访、保密等，以及后勤、财务、考勤等工作。负责干部考核、任免、调动及退休事宜，组织环境保护宣传和信息工作，执行领导交办的其他任务。
2. 污染控制股: 制定污染控制计划，推行污染治理，指导全县环境管理工作，负责排污许可证发放和污染源治理。负责危险废物、有毒化学品和放射源的监管，组织城市环境综合管理和考核。协调环境污染事故预防和调查，推动企业环境信息公开。
3. 自然生态股: 负责生态保护政策的拟定和实施，编制生态保护规划，负责农村生态环境保护和生态示范区建设。确保生态环境安全，协助申报生态村、乡镇和县。
4. 项目管理股: 制定建设项目环保管理法律宣传计划，审批环境影响评价文件，参与建设过程中的“三同时”监管，组织项目竣工验收。
5. 行政审批股: 主管环境影响评价、建设项目环保设施验收等审批工作，研究制定审批流程，规范实施程序，参与联合审批，并监督相关机构和人员资质。
6. 环境监察大队: 宣贯环保法规，负责环境监理和排污费征收，处理环境信访，监督重点源，监管在线监测设备，执行环保执法，处理环境违法行为，建立排污档案，负责排污费征管和污染设施检查。
7. 环境保护监测站: 执行环保监测法规，参与规划制定，实施环境质量监测，建立环境数据库，提供应急监测数据，为社会提供咨询监测服务，开展科研监测。