因为秦桧一味屈膝求和，在抗金节节胜利之际，力主议和，并暗恨岳飞于心，诬告岳飞谩骂先皇、意图谋反、受旨意却不服从等众多莫须有的罪名，将抗金名将岳飞处死，所以秦桧是千古罪人。
绍兴十年（公元1140年）五月，金国在盟墨未干、血口犹在的情况下，单方面撕毁了和约，倾举国之兵南下略宋。
南宋新任的东京副留守刘锜在顺昌府对金兵进行强有力的反击，一番较量下来，把兀术打得七辇八素，打出了南宋军队的威风，但金军人数众多，赵构命岳飞出兵助援。
岳飞一面命张宪和姚政率前军与游奕军由光州往顺昌府方向疾奔，一面派遣部将王贵、牛皋、董先、杨再兴等人从鄂州分头并发，北向进军。岳家军势如破竹、挥军北上之际，其他的张俊淮西兵团、淮北宣抚判官杨沂中部、淮东宣抚使韩世忠部、西部战场上吴璘部，也都各显神通，把各个战场上的金兵金将打得满地打滚。
可是，在这节骨眼上，被金国安置在南宋朝廷里的奸细秦桧发挥了无间道的作用，他进言赵构，要求全面停战，赵构随即给战场上的每一位指战员都下达了撤军令，随即以十二道金牌招岳飞，岳飞悲愤莫名，据理力争，不同意撤军，随后指挥军队取得了郾城大捷和颍昌大捷。
而后作为主和派的秦桧，开始与金军议和，在与金军交涉过程中，金军提出了一条议和意见：始杀飞，方可和。不久岳飞、韩世忠等人便被罢免了军权。随后秦桧又策反岳飞手底下的人，网罗岳飞谋反的“证据”，以莫须有的罪名加在岳飞身上。随即，岳飞被拘捕，岳云、张宪也被拘捕。
绍兴十一年十二月二十九日（1142年1月27日），万俟卨等通过秦桧上报奏状，提出将岳飞处斩刑，张宪处绞刑，岳云处徒刑。宋高宗赵构当日批复：“岳飞特赐死。张宪、岳云并依军法施行，令杨沂中监斩，仍多差兵将防护。
无论是古人还是现代人，都喜欢用忠诚、正直来评判一个人，好比关羽，关羽忠心耿耿，义勇双全，历来被人们所称赞，岳飞忠心耿耿，精忠报国，为国为民鞠躬尽瘁，而秦桧哪？却利用莫须有的罪名，诬陷忠良，杀害抗金名将岳飞，只能是一个罪人，遭受千年骂名。
1. 在金朝入侵南宋期间，他主张议和。当时，金朝和南宋的争斗在很大程度上已经失去了平衡，南宋军队无法抵挡金朝强大的攻势。秦桧力主同金朝达成和议，以损害自身尊严和国土为代价换取和平。这使得南宋失去了进一步恢复统一的可能性，为后世留下了难以磨灭的耻辱。
2. 秦桧所推行的对内政策使国家空前贫弱。在其担任宰相期间，他对南宋国内实行严格的调控，限制军事开销，削减军队数量，导致国家武力严重减弱。同时，他充满腐化和偏见的官员选拔政策，使得治理水平下降，国家空前腐败，从根本上削弱了南宋的国力。
3. 永嘉之围。寿永五年（1135年），金朝攻陷南宋太平县，南宋损失惨重。这场失利也与秦桧推行的削弱军事力量和腐化官员选拔政策有着重要的关系。
4. 反对岳飞。岳飞是南宋时期著名的抗金英雄，秉持恢复中原，收复失地的信念。然而，秦桧在当时为实现其和金方案，与岳飞性格背道而驰。他极力反对岳飞，不仅暗中阻挠其作战，还进一步诬陷、陷害岳飞以及其手下将领，并致使岳飞于金兵劫掠之际被罢免并被杀。在后世，岳飞被视为民族英雄，秦桧对岳飞的陷害使他在历史上背负了恶行不堪的罪名。
因此，秦桧这个历史人物因为他的让国家民族丧失尊严的议和主张及对国家政和民族雄的破坏等一系列行为，被后世视为罪人。