鸡的呼吸系统疾病可分为病毒性呼吸系统疾病、支原体呼吸系统疾病、细菌性呼吸系统疾病等，当鸡的呼吸系统出现异常时，应首先诊断出哪种类型的呼吸系统疾病。
病毒性呼吸道和支原体的区别如下：病毒性呼吸系统疾病的主要特点是传播速度较快或具有一定的传染性，有的有异响，呼吸困难增高。传染性支原体类慢，不易发现：鸡以打喷嚏为主，咳嗽明显，打鼾节律非常平稳，有的认为鸡的健康发育不明显，细菌性呼吸道疾病与支原体相似，但也容易与病毒性呼吸道疾病相鉴别。与病毒性呼吸道疾病不易鉴别，鼻炎的特点是面部肿胀，鸡鼻腔有一定量的液体、鼻涕，这与病毒性呼吸道疾病不同。
鼻炎和流感的区别如下：鼻腔骨质肿胀充血，病程较长的鸡气管增厚，鼻炎感染迅速，与其他细菌性呼吸道疾病明显不同，发病初期以咳嗽为主，仔细观察早期鼻腔流淌的清白色或黄色的鼻液，使鼻孔内的鼻涕物质排出。目前，眼睑三角区先肿胀。在严重的情况下，整个眼睛肿胀，并成为浅红色水肿。这与轻度流感和E型头肿不同。本病无明显死亡，与其他疾病不同。
鼻气管炎与其他疾病的区别如下：鸡鼻气管炎。该病可感染任何年龄的鸡，尤其是雏鸡。临床上，该病的主要表现是治疗往往无效，ND疫苗也无效，呼吸道的主要异常是咳嗽，主要原因是咳嗽的鸡多，有些鸡在夜间有呼噜声，没有死鸡现象，感染很快，但鸡很瘦；病程可长达数月；常见的呼吸道疾病有新城疫、肾性支气管炎、支原体和鸡鼻气管炎，鼻腔有出血点，气管内有白色粘液，骨质肿胀。脸部浮肿流泪。特别注意不要与鼻炎混淆，鼻炎药物无效。
判断：为防治鸡病毒性呼吸道疾病，应首先对新城疫进行鉴别诊断。只有新城疫的治疗是特异性的，其他病毒性呼吸道疾病的基础治疗是相似的；新城疫对常用抗病毒药物几乎无效，其主要呼吸道症状为咳嗽、尖叫、尖叫；直到大量药物见效，或效果不理想时，才应考虑新城疫！
新城疫鸡群的粪便中有黄色的松散粪便，堆积的类型有一美元硬币大小，粪便中有黄色的松散粪便，有像猪饲料一样的青草石，虽然新城疫的非典型性病变似乎不是典型的粪便改变，但解剖变化与典型病变相似，新城疫的解剖鉴定应基于以下五个特点：从盲肠扁桃体到盲肠末端四厘米范围内有突出物，出血；鼓包的大小和出血的严重程度仅表明其严重程度与鸡体大小有关，但均由本病引起，鼓包的数目从1到3不等。
回肠和盲肠有肿块和出血，严重者突出明显，出血更严重。在严重的情况下，突出物中会形成一个粘乎乎的绿色或黄色突出物。有些DelEs不出血，有些DelEs只是轻微的，有多个出血点。