1/4杯的珍珠奶茶中含有136大卡的热量，该数据来自美国农业部全国营养数据库。
虽然木薯粉圆不含糖或只含极少量的糖，但是每1/4杯的珍珠奶茶中含有1g糖，珍珠本身就富含大量碳水化合物，而且基本上没有其他营养。
100g的珍珠中88%质量来自碳水化合物，可是消化纤维素和蛋白质的含量只有1g。
常饮珍珠奶茶几个危害：
容易发胖
反式脂肪酸不容易被人体消化，容易在腹部积累，导致肥胖。
多喝奶茶对人体有非常多坏处奶茶是高糖、高油、高热量。奶茶加的奶精，多由椰子油制成，椰子油中含大量饱和脂肪酸，会加速体内制造胆固醇，血脂肪也会急速上升，形成血管硬化，长时间大量饮用，容易罹患高血压、糖尿病等慢性病。
曾有统计数字显示，大量饮用奶茶超过三个月，血脂肪及胆固醇都会升高。奶茶只是油和糖的结合，因为奶精并非牛奶制成品，奶茶中又有大量糖分，几乎不含钙还对身体有非常大的伤害。奶茶最好不要天天喝，一周顶多喝个一、两杯解个馋即可。
加剧高血压
咖啡因因为本身具有的止疼作用，常与其他简单的止疼剂合成复方，但是，长时间大量服用，如果你本身已有高血压时，使用大量咖啡因只会使你的情况更为严重。因为光是咖啡因就能使血压上升，若再加上情绪紧张，就会产生危险性的相乘效果，因此，高血压的危险人群尤其应避免在工作压力大的时喝含咖啡因的饮料。有些多年有喝咖啡习惯的人，以为他们对咖啡因的效果已经免疫，然而事实并非如此，一项研究显示，喝一杯咖啡后，血压升高的时间可长达12小时。
而奶茶中的反式脂肪酸会增加人体血液的黏稠度和凝聚力，容易导致血栓的形成，对于血管壁脆弱的老年人来说，危害尤为严重。
诱发骨质疏松
咖啡因本身具有非常好的利尿效果，如果长时间且大量喝咖啡，容易造成骨质流失，对骨量的保存会有不利的影响，对于妇女来说，可能会增加骨质疏松的威胁。但前提是，平日食物中本来就缺乏摄取足够的钙，或是不总是动的人，加上更年期后的女性，因缺少雌激素造成的钙质流失，以上这些情况再加上大量的咖啡因，才可能对骨造成威胁。如果能够按照合理的量来享受，你还是可以不可以做到不因噎废食的。
紧张时添乱
咖啡因有助于增强警觉性、灵敏性、记忆力及集中力。但饮用超过比你平常所习惯饮用量的咖啡，就会产生类似食用相同剂量的兴奋剂，会造成神经过敏。对于倾向焦虑失调的人而言，咖啡因会导致手心冒汗、心悸、耳鸣这些症状更加恶化。
易患不孕症
研究人员统计发现，每天饮1杯咖啡的妇女比不饮咖啡的妇女易患不孕症。有关专家曾调查了有饮用咖啡习惯的104名妇女，其中约有50名妇女不易受孕。也有些生育专家认为，这是小范围的研究，不能最后证实咖啡对生育的特殊作用。但是，研究人员强调指出如果不能从医学上说明不育症的原因，则应考虑不育症与咖啡因有关。
而奶茶中的反式脂肪酸会减少男性荷尔蒙的分泌，对精子的活跃性产生负面影响，中断精子在身体内的反应过程。
对胎儿有危害
怀孕期或哺乳期的妇女，过多摄入含有反式脂肪酸的食物会影响胎儿的健康。研究发现，胎儿或婴儿可以通过胎盘或乳汁被动摄入反式脂肪酸，他们比成人更容易患上必需脂肪酸缺乏症，影响生长发育。
增加心梗危险
美国波士顿大学公共卫生学院的医学家们通过对858例在45～69岁首次患心肌梗塞的妇女和858例从未患过心肌梗塞的妇女进行了为期4年的研究，结果表明，每日饮5杯或更多的咖啡，可使妇女患心肌梗塞的危险增加70%，而且危险性随着饮咖啡的数量增加而增加。
根据法国国家健康与医学研究所的一项最新研究成果表明，反式脂肪酸能使有效防止心脏病及其他心血管疾病的胆固醇的含量下降。
易引起糖尿病
芬兰和美国的研究人员通过调查分析发现，这两个国家都是消费咖啡最多的国家，其结果是，这两个国家中患糖尿病的人数也最多。其中，芬兰人的咖啡消费量居世界之首，该国的糖尿病患者也是世界上最多的。其它北欧国家的咖啡消费量也大，患糖尿病的人数也多。相反，日本人的咖啡消费量在世界上是最少的，糖尿病患者也最少。
研究者分析认为，咖啡饮料中含有的咖啡因可以透过胰脏而沉淀到胎儿组织中，尤其是胎儿的肝脏、大脑，使出生后的婴儿可能患糖尿病。
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