现在日本还是有许多网站的历史资料都提供了数据库服务。善于利用的话，能看到不少有用的资料。此处以前近代史为例，进行说明。
1 东京大学史料编纂所网站。提供
《大日本史料》，《大日本古记录》，《大日本古文书》等一系列资料的检索与阅览。除此之外，还有崩字检索系统和其他一些资料，比如《平安遗文》，《镰仓遗文》等。
2 国立国会图书馆网站。提供过了版权期的一些书籍的免费阅览。战前编纂的历史资料都可以看到，比如《群书类从》全系列和旧版《国史大系》的一部分。
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日文研网站提供的《古事类苑》检索阅览服务。虽然《古事类苑》的电子化还在进行中，但是目前已经有许多部分都提供检索了。这套书类似于我国的“政书”，即典章制度史。对相关方面感兴趣的可以搜索试试看。
4 悠久之绊。这是台湾人做的网站，录入了一些主要的日本古代典籍，比如
《六国史》《延喜式》等。与前述《国史大系》有重复的部分。
差不多以上就是目前能够利用的在线基本资料网站。不知道你对
日本历史哪一段时期感兴趣，如果能够具体说一下的话，我可以给出更详细的意见。因为百度知道回答规范，以上都没有给出网站链接，但是比较好找，只要在百度搜一下也能搜到。如果有什么问题，欢迎继续追问。