这个问题对普通大众来说着实有些难度
我用我高考水平的基础科学素养聊几个吧，不喜勿喷哈
1.运火石飞机群体坠毁：木星引力抢夺地球大气，导致大气稀薄，机翼上下表面的流速差带来的升力不足。
2.点燃木星大气：木星大气主要为氢气，较纯氢气和稀薄的氢气都无法爆燃，而抢夺混合了地球大气中的部分氧气后，局部浓度可以爆燃。
3.冲击波传播：空气震动的冲击波纵波无法在真空中传播，和真空中无法传播声音的原理一致。所以冲击波顺着大气空气柱，很细得震动过来，提供了单点的推力。电影中的破坏效果可能表现的太小，但打击范围还算合理。
4.空间站休眠导致通讯阻断：环绕地球的同步卫星，气候卫星，通宵微信，都是在制造火箭时就计算好轨道的，势必无法跟着地球一起流浪，宇宙通讯站的重任全落在了“领航者”身上。低功耗模式导致地面大部分长距离通讯失效合理。
5.地表光照：来自于发动机火焰照亮大气，电影中提到“晨昏线”“永夜”，本是现实中南极圈北极圈的现象，电影中是由于主角团接近了环赤道发动机带，地球另一面是既没有太阳也没有发动机光照的永夜。
6.气温争议：有人提出气温与红巨星太阳宜居带的bug（在其他问题里有人说木星旁边可能是宜居带，我不细讲），我觉得毕竟大气稀薄了 地球还有一面永夜的低温空气 发动机也会发热，各种此消彼长，电影里爱说多少度是多少度，谁也算不清，你说人家零下80度太低或太高不合理，好像有点吹毛求疵了。
最后我想说，欢迎指教 哈哈
不合理。
现代所谓科幻，是不科学的假设。
这种假设，是来自于西方的宗教神话捆绑了科学，是类人对人类科技的亵渎。
科技，必须是合理的结果，不合理的科技必定是谎言和欺骗。
物理学，就是人类道理的一种科学技术的手段与方法，必定是合理的。
……
为此，虽然现代无厘头的故事都扯上科幻的借口，但终归是不合理的，科幻就会成为被揭穿的谎言，却仍不矢为激励少年儿童积极探索科学的动力。
地球冲向木星的过程中，由于地球的质量远大于空气，根据万有引力木星对地球的吸引力要比空气大得多，所以地球一定是冲在前面，空气远远被甩在后面。所以等氢氧混合时地球早进去了。
再说，就算地球的大气层没被拉成彗星状，当氢氧混合时，人离木星就一定很近了，应该能明显感觉到木星造成的重力，换句话说人和地球都以几个G的加速度冲向木星，这时又来了个反向冲力，这不比从高空中摔到地上惨多了?
我们常听说撞击地球的彗星相当于多少颗氢弹的能量，那地球撞木星是多少颗氢弹的能量，岂是氢氧爆燃气体能挡得住的？而且爆燃气体的能量还是四散的就更没力。
冲击波的传播速度就是光速，如果需要几分钟才到的话，木星和现在的实际距离也差不多。