一、指代不同
1、全文搜索引擎：通过从互联网上提取的各个网站的信息（以网页文字为主）而建立的数据库中，检索与用户查询条件匹配的相关记录，然后按一定的排列顺序将结果返回给用户。
2、目标索引类搜索引擎：是以网页形式提供查找网络资源的一种网络信息检索工具。
二、特点不同
1、全文搜索引擎：以各类数据如文本、声音、图像等为对象，提供按数据的内容而不是外在特征来进行的信息检索，其特点是能对海量的数据进行有效管理和快速检索。
2、目标索引类搜索引擎：使用自动索引软件来搜集和标记网页资源，并将这些资源存入数据库。当用户输入检索的关键词后，它在数据库中找出与该词匹配的记录，并按相关程序排序后显示输出。
三、影响不同
1、全文搜索引擎：是搜索引擎的核心技术，同时也是电子商务网站的支撑技术。全文检索技术可应用于企业信息网站、媒体网站、政府站点、商业网站、数字图书馆和搜索引擎中。
2、目标索引类搜索引擎：由自动索引软件生成数据库，所收录的网络资源范围广、速度快、更新及时，但因缺乏人工干预，准确性较差。这类检索工具适用于查找特定的信息以及专指性强或不易明确分类的具体问题，例如百度搜索引擎。
参考资料来源：百度百科-索引型搜索引擎
参考资料来源：百度百科-全文搜索引擎
一、指代不同
1、全文搜索引擎：从互联网上提取每个网站的信息（主要是网页文本），检索符合用户查询条件的相关记录，然后按一定顺序将结果返回给用户所建立的数据库。
2、目标索引搜索引擎：是一种以网页形式查找网络资源的网络信息检索工具。
二、特点不同
1、全文搜索引擎：以文本、语音、图像等各种数据为对象，提供基于数据内容而非外部特征的信息检索，具有对海量数据进行有效管理和快速检索的特点。
2、目标索引搜索引擎：使用自动索引软件收集和标记Web资源，并将这些资源存储在数据库中，当用户输入关键字时，在数据库中找到与关键字匹配的记录，并根据相关程序排序后显示输出。
三、影响不同
1、全文搜索引擎：是搜索引擎的核心技术，也是电子商务网站的支撑技术，全文检索技术可应用于企业信息网站、媒体网站、政府网站、商业网站、数字图书馆和搜索引擎。
2、目标索引搜索引擎：数据库是由自动索引软件生成的，其中包含的网络资源范围广，更新速度快，及时，但由于缺乏人工干预，准确性差，这种搜索工具适合于查找特定信息和特定问题，具有很强的特异性或难以明确分类，如百度搜索引擎。
参考资料来源：
本回答被网友采纳全文搜索引擎与目标索引类搜索引擎区别在于：
全文搜索引擎是目前广泛应用的主流搜索引擎。它的工作原理是计算机索引程序通过扫描文章中的每一个词，对每一个词建立一个索引，指明该词在文章中出现的次数和位置，当用户查询时，检索程序就根据事先建立的索引进行查找，并将查找的结果反馈给用户的检索方式。这个过程类似于通过字典中的检索字表查字的过程。
国外具代表性的有Google、Fast/AllTheWeb、AltaVista、Inktomi、Teoma、WiseNut等，国内著名的有百度（Baidu）。它们都是通过从互联网上提取的各个网站的信息（以网页文字为主）而建立的数据库中，检索与用户查询条件匹配的相关记录，然后按一定的排列顺序将结果返回给用户，因此他们是真正的搜索引擎。
从搜索结果来源的角度，全文搜索引擎又可细分为两种，一种是拥有自己的检索程序（Indexer），俗称“蜘蛛”（Spider）程序或“机器人”（Robot）程序，并自建网页数据库，搜索结果直接从自身的数据库中调用，如上面提到的7家引擎；另一种则是租用其他引擎的数据库，并按自定的格式排列搜索结果，如Lycos引擎。
目录索引
目录索引虽然有搜索功能，但在严格意义上算不上是真正的搜索引擎，仅仅是按目录分类的网站链接列表而已。用户完全可以不用进行关键词（Keywords）查询，仅靠分类目录也可找到需要的信息。目录索引中最具代表性的莫过于大名鼎鼎的Yahoo雅虎。其他著名的还有Open Directory Project（DMOZ）、LookSmart、About等。国内的搜狐、新浪、网易搜索也都属于这一类。
搜 索 引 擎 分 类
搜索引擎按其工作方式主要可分为三种，分别是全文搜索引擎（Full Text Search Engine）、目录索引类搜索引擎（Search Index/Directory）和元搜索引擎（Meta Search Engine）。
■ 全文搜索引擎
全文搜索引擎是名副其实的搜索引擎，国外具代表性的有Google、Fast/AllTheWeb、AltaVista、Inktomi、Teoma、WiseNut等，国内著名的有百度（Baidu）。它们都是通过从互联网上提取的各个网站的信息（以网页文字为主）而建立的数据库中，检索与用户查询条件匹配的相关记录，然后按一定的排列顺序将结果返回给用户，因此他们是真正的搜索引擎。
从搜索结果来源的角度，全文搜索引擎又可细分为两种，一种是拥有自己的检索程序（Indexer），俗称“蜘蛛”（Spider）程序或“机器人”（Robot）程序，并自建网页数据库，搜索结果直接从自身的数据库中调用，如上面提到的7家引擎；另一种则是租用其他引擎的数据库，并按自定的格式排列搜索结果，如Lycos引擎。
■ 目录索引
目录索引虽然有搜索功能，但在严格意义上算不上是真正的搜索引擎，仅仅是按目录分类的网站链接列表而已。用户完全可以不用进行关键词（Keywords）查询，仅靠分类目录也可找到需要的信息。目录索引中最具代表性的莫过于大名鼎鼎的Yahoo雅虎。其他著名的还有Open Directory Project（DMOZ）、LookSmart、About等。国内的搜狐、新浪、网易搜索也都属于这一类。
■ 元搜索引擎 (META Search Engine)
元搜索引擎在接受用户查询请求时，同时在其他多个引擎上进行搜索，并将结果返回给用户。著名的元搜索引擎有InfoSpace、Dogpile、Vivisimo等（元搜索引擎列表），中文元搜索引擎中具代表性的有搜星搜索引擎。在搜索结果排列方面，有的直接按来源引擎排列搜索结果，如Dogpile，有的则按自定的规则将结果重新排列组合，如Vivisimo。
除上述三大类引擎外，还有以下几种非主流形式：
1、集合式搜索引擎：如HotBot在2002年底推出的引擎。该引擎类似META搜索引擎，但区别在于不是同时调用多个引擎进行搜索，而是由用户从提供的4个引擎当中选择，因此叫它“集合式”搜索引擎更确切些。
2、门户搜索引擎：如AOL Search、MSN Search等虽然提供搜索服务，但自身即没有分类目录也没有网页数据库，其搜索结果完全来自其他引擎。
3、免费链接列表（Free For All Links，简称FFA）：这类网站一般只简单地滚动排列链接条目，少部分有简单的分类目录，不过规模比起Yahoo等目录索引来要小得多。
由于上述网站都为用户提供搜索查询服务，为方便起见，我们通常将其统称为搜索引擎。本回答被提问者采纳
主要该系统有TRS系统·天宇系统·等
与其他搜索引擎相比，全文搜索引擎的显著特点是它能够以文中任何一个有检索意义的词作为检索入口，而且取得的检索结果是原始文献，而不是文献线索
随着计算机产业的发展，以计算机存储设备为载体的电子信息愈来愈多，这些信息大致可分为两类：结构化数据和非结构化数据，结构化数据指的是诸如企业财务帐目和生产数据、学生的分数数据等等，非结构化数据的则是一些文本数据、图象声音等多媒体数据等等。据统计，非结构化数据占有整个信息量的80%以上。对于结构化数据，用RDBMS（关系数据库管理系统）技术来管理是目前最好的一种方式。但是由于RDBMS自身底层结构的缘故使得它管理大量非结构化数据显得有些先天不足，特别是查询这些海量非结构化数据的速度较慢。而通过全文检索技术就能高效地管理这些非结构化数据。
经过几年的发展，全文检索从最初的字符串匹配程序已经演进到能对超大文本、语音、图像、活动影像等非结构化数据进行综合管理的大型软件。由于内涵和外延的深刻变化，全文检索系统已成为新一代管理信息系统的代名词，衡量全文检索系统的基本指标也逐渐形成规范。
首先，我们关注的是查全率，即系统在进行某一检索时，检索出的相关资料量与系统资料库中相关资料总量的比率。查准率则是保证我们找到最有用资料的一个关键，是系统在进行某一检索时，检索出的有用资料数量与检索出资料总量的比率。检索速度或者说响应时间是提高工作效率的保障，指的是从提交检索课题到查出资料结果所需的时间。最基本的检索速度是应该达“千万汉字，秒级响应"。还有诸如收录范围（所查找的范围）、用户负担（用户在检索过程中付出精力的总和）、输出形式 （输出信息表现形式）等指标也是衡量全文检索系统优劣的要素。
搜索引擎应该是全文检索技术最主要的一个应用。目前，搜索引擎的使用已成为排在收发电子邮件之后的第二大互联网应用技术。搜索引擎起源于传统的信息全文检索理论，即计算机程序通过扫描每一篇文章中的每一个词，建立以词为单位的到排文件，检索程序根据检索词在每一篇文章中出现的频率和每一个检索词在一篇文章中出现的概率，对包含这些检索词的文章进行排序，最后输出排序的结果。全文检索技术是搜索引擎的核心支撑技术。
一个好的检索引擎是一个理想站点的关键。很多人在访问一个站点时喜欢使用站点检索，站点检索应是分类目录导航和全文检索的完美结合，具体包括以下几个方面：
分类目录导航的关键是检索范围，检索范围的限制能使得检索结果不会太多、太滥；
全文检索对于站点检索是必不可少的，在通常情况下能够帮助人们很快地找到所要的网页；
有时利用分类目录导航和全文检索还很难定位到所要的信息，这时就要组合检索辅助；
必须有相关排序功能，因为当检索结果太多时，用户不可能一一浏览，大多数用户只浏览前面几条，没有相关排序，可能准确的检索结果排在后面，用户不能浏览到，而排在前面的检索结果却相关性很少，造成用户的错觉。
此外，我们还要考虑HTML/XML的特殊性、支持大量并发用户突发访问、Web站点的动态特性、要求索引维护效率很高等方面。
目前的技术实现有Lucene，Solr，ElasticSearch等。全文检索过程分为索引、搜索两个过程：
索引(Indexing)
从关系数据库中、互联网上、文件系统采集源数据(要搜索的目标信息)，源数据的来源是非常广泛的。
将源数据采集到一个统一的地方，例如存储系统，要创建索引，将索引创建到一个索引库（文件系统）中，从源数据库中提取关键信息，从关键信息中抽取一个一个词，词和源数据是有关联的。也即创建索引时，词和源数据有关联，索引库中记录了这个关联，如果找到了词就说明找到了源数据（http的网页、电子书、新闻等……）。
搜索(Search)
用户执行搜索（全文检索）编写查询关键字。
从索引库中搜索索引，根据查询关键字搜索索引库中的一个一个词。
展示搜索的结果。