农村土地纠纷问题，原则上属于一般的民事纠纷，可以找以下部门依法处理：
1、村委会或镇、乡政府，或者县政府土地管理部门调解处理；
2、可以找土地管理部门进行确权申请；
3、可以向法院提起诉讼；
4、其他部门。
纠纷处理方法：
1、相互调解：
农村土地出现纠纷大多是同一个家庭成员之间较为常见，亲戚之间出现纠纷的话，首先就是相互协商调解，也有的找自己家族里面比较有威望的老人来裁决。如果不是牵涉到很大利益的土地纠纷，一般的通过家庭内的和解都能解决，毕竟都是自家人也比较好说话。一般一个村里的人都有点沾亲带故的，所以调解起来一般也比较容易；
2、村委会调解：
如果是相互之间调解不了的土地纠纷矛盾，这个时候农民们一般都会找到村委会来调解。因为农村土地的分配就是村集体进行的，所以对农民各自的土地承包经营权了解比较清楚，而且村干部对村里各农民家里的情况也都比较了解，处理村民之间的矛盾也很有经验，因此在农村调解土地纠纷的过程中也发挥了很大的作用。
3、县市仲裁：
如果村一级的委员会无法解决农民之间的土地纠纷问题，那么农民们还可以向更高一级的县市申请仲裁。我国有专门的法律，其中就明确规定了农民土地出现纠纷之后仲裁的具体流程及方式。如果农民们需要申请仲裁的需要提前了解这部立法，对仲裁的具体形式以及内容了解清楚，这样才能很好的维护自己的合法权益。
最后，解决农村土地纠纷有很多途径，比如当地村民委员会、乡镇人民政府、农村土地承包仲裁机构、人民法院起诉。也可以自行协商调解、调解解决、仲裁解决等。
综上所述，农村土地发生纠纷的，双方协商不成的，可以找当地的乡（镇）人民政府进行调解，或者村民委员会进行调解。当事人也可以选择仲裁或者直接向人民法院起诉。
【法律依据】：
《中华人民共和国土地管理法》第十六条
下级土地利用总体规划应当依据上一级土地利用总体规划编制。
地方各级人民政府编制的土地利用总体规划中的建设用地总量不得超过上一级土地利用总体规划确定的控制指标，耕地保有量不得低于上一级土地利用总体规划确定的控制指标。
省、自治区、直辖市人民政府编制的土地利用总体规划，应当确保本行政区域内耕地总量不减少。
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