1、对肌体的直接伤害
许多药物如果不适当的使用，往往造成对一些脏腑的直接伤害，如：各种抗生素对肝肾功能的直接的伤害，放射性治疗对肌体局部的直接伤害，化学疗法对胃黏膜及骨髓造血机能的破坏作用等。
2、抑制和破坏脏腑功能、导致内分泌的永久性失衡
临床使用大量激素类药物，均会导致相应的脏腑功能受到抑制，造成患者内分泌严重失调而终生依赖药物。
3、破坏和抑制人体自身修复疾病的康复功能
药物的无节制使用，往往会造成人体自身功能的抑制，人类与生活在地球上的所有生命一样，本身就具备生存所需要的、保证健康的三大功能。
(1) 抵抗外来病毒、细菌感染的免役功能;(2) 康复 肌体病变的自愈功能;
(3) 修复 肌体因病、因伤而缺损的生命再造功能。
无节制地滥用药物，必定会导致各种药物取代人体自身固有的、为生存需要所具备的三大功能，使人体康复功能被药物取代而长期废弃不用。人类的功能用则进、不用则退，长期依赖各种药物必定会使自身的康复功能丧失贻尽。尤其令人担忧的是：一代人的功能退化还会经遗传贻害于我们的子孙后代，造成人类整体物种对疾病的康复功能全面退化。
4、滥用药物导致大量的细菌、病毒进化成对人类健康危害更大的新病株抗生素的发现，解决了不少因细菌病毒所感染的多种传染病，为人类的健康事业作出了一定的贡献。但任何事物都具有两面性，当临床的医生们过于夸大、甚至迷信药物的治疗作用时，便造成了当今医学界普遍存在的滥用抗生素的现状。患者偶有小疾，便大量使用抗生素，不但给患者带来严重的毒副作用，还促使不少细菌病毒加速进化、成为毒性更大、耐药性更强的新病株，药物的研究周期远远落后于病毒细菌的进化。
5.据统计80%的西药对染色体有诱变作用，这一点对于长期服药的病患者危害更大，有的产生药物依赖性(不服药症状加剧)，有的产生药物抵抗性(剂量加大)。
西药不仅导致各种药源性疾病，而且可诱发或加重与老化有关的各种疾病，促进人体老化;
西药对人体疾病治疗不但有其局限性，而且给人体带来了不可低估的毒副作用。
据世界卫生组织近年来的统计报道，在临床发病率中，
大约有30%属于药源性疾病(由于药物副作用引起的)。
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