崂山山区的野生动物，大体分为兽类、鸟类、海洋生物类和淡水鱼类。据《元史》记载，古代崂山有虎，已绝迹。
清同治版《即墨县志》记载，清以前崂山狼较多，深山内白昼可见。1930年青岛市政府公布准许猎狩之野生动物有“野猪、狼、兔、狐狸、野猫、鼬鼠等”。1949年后，崂山的主要野生兽类有狐狸、野兔、獾、貉、黄鼬等。清同治版《即墨县志》记载，崂山有乌鸦、莺、鸠、雉、雁、凫、鸢、鹰、鸨、鸥、鹳、灰鹤、燕、布谷、仓庚、鸽、啄木、寒号、鸳鸯、鹊、雀、鹑等28种鸟类。1930年鸟类专家寿振黄对崂山的鸟类进行了系统调查，记载了鹊、雀、燕、雁等250余种。1983年崂山县鸟类自然保护区管理站对崂山的鸟类资源进行了调查，发现崂山共有鸟类230余种，隶属10目、30科、63属，其中食虫鸟86种、食鼠鸟17种。据1984年就225种鸟类进行的调查，计有留鸟15种、夏候鸟85种、冬候鸟18种、旅鸟107种。其中属国家保护的珍禽，一类的4种，二类的28种。另据野外调查统计，1986年途经崂山的候鸟多达300多万只，其中属国家保护的珍禽和猛禽多达50万只以上。
崂山海洋资源丰富，沿海鱼种约87科、155属、200余种。沿海15米等深线以内生物主要为贝类、甲类、软体类及藻类，共有310余种。
崂山野生淡水鱼类有4科、9属、9种。 崂山山区植物分木本植物和草本植物两大类。
木本植物有72科、156属、328种和变种，多为自然野生，资源极其丰富。
崂山山区的杂草、野花等草本植物有900余种，其中以禾本科、菊科、豆科、藜科为常见品种。 明代黄宗昌《崂山志》记载：“药材不下百余种，黄精、天门冬、苓术其最盛也。”清代《即墨县志》记述了63种主要药材的名称。根据1984年普查资料统计，崂山共有中药材681种，其中植物类药材153科622种；动物类药材50科54种；矿物类药材5种。探明崂山药材总蕴藏量达1120万公斤。
