有的细菌对对虾来说是有害的，有的细菌对对虾来说是有益的。如导致对虾红腿病、烂鳃、黄鳃及黑鳃等的细菌是一些条件致病菌，它们对对虾是有害的，在养殖过程中要想方设法控制它们。而有些细菌，如枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、乳酸杆菌和光合细菌等，在对虾养殖过程中它们能够利用水体中的有害物质转变成为无害的或者是有益的物质，所以在对虾养殖过程中，要注意培养或者添加这些有益菌。
细菌性疾病在对虾养殖中最为常见，而且是危害较大的一类疾病。与病毒病不同，病原可以进行人工培养，在光学显微镜下一般都可以看见，用化学药物可以进行防治，细菌从形态可以分为球菌、杆菌和螺旋菌三大类。细菌属于原核生物，即细胞核没有核膜和核仁，没有固定的形态，仅是含有DNA的核物质。所有细菌可分为革兰氏染色阴性（红色）和为革兰氏染色阳性（紫色）两大类。大多数革兰氏染色阴性细菌为条件致病菌，平时生活在水体中、底泥中或健康的虾体上，在虾体受伤或环境条件恶化时，就可能大规模繁殖，进而侵入对虾体内并引发细菌性疾病。