1、外部结构
(1)在机身前部下方的大型、可收回的雷达天线屏蔽器，安装了飞机独特的“igLook”天线，旋转接受器可以从360度获取飞机周围的电子信号。
(2)机身上方的顶部凸起物，安装了一些信号接受器和发射器。
(3)机身下方的腹部凸起物，也安装了特殊天线。
(4)外部天线放置在机身后部及脊骨部分。
(5)尾部锥形物安装了电子设备。
(6)头锥体。
(7)EP-3飞机正在用更先进的接受机、通信、信号处理系统和计算机显示器进行更新。
2、内部结构
(1)可视观测工作站
(2)可供两人同时操作的导航舱
(3)可供五人同时操作的通信情报机舱
(4)机载卫生间
(5)机组人员休息室
(6)飞行甲板
(7)飞机指挥工作站
(8)未经确认的工作站
(9)人工ELINT工作站
(10)低波段信号收集工作站
(11)高波段信号分析工作站
(12)igLook操作工作站
(13)ELINT监视工作站
(14)电子战协调工作站EW
(15)通信情报监视/收集主管工作站
(16)逃生出口(左口舷)
(17)主机舱入口
(18)通信情报工作站
(19)走廊
美EP-3E电子侦察机中未经确认的工作站位于飞机主机舱头部，由一位飞行维护技术人员负责。人工电子信号情报工作站位于电子支援舱头部，后者位于飞机主机舱中部。
ELINT操作员的主要职责就是进行信号情报分析、接受器控制，当飞机上的骨干计算机系统出现故障时，该工作站将作为电子支援雷达的主要操作平台。低波段信号收集工作站位于人工电子信号情报工作站的旁边，其任务包括早期预警、飞行高度测定以及收集气象雷达发送的信息。
高波段分析工作站位于低波段信号收集工作站的旁边，其职责包括对高波段雷达发射的信号进行分析并将分析结果发送到中央计算机系统。
igLook操作工作站位于高波段分析工作站的旁边，职责包括管理EP-3EAN/APS-134(V)雷达及飞机的远程ES接受装置并对新接受的信号进行评估。ELINT监视工作站位于igLook操作工作站的旁边，正如其名称描述的那样，负责对ES机舱进行监视。电子战协调工作站：位于ELINT监视工作站的旁边，主要职责包括将收集到的人工电子信号情报以及通信和情报数据集中起来并传输给非机载用户。
通信情报特殊任务监视/收集主管工作站：位于电子战协调工作站的旁边，主要职责包括对飞机的通信情报进行管理。通信情报机舱位于飞机右舷主机舱尾部，可为5名操作员提供住宿条件，职责为收集、分析以及整编通信情报。主机舱尾部还可为第6名操作员提供操作空间。
EP-3E电子侦察机