论文查重的重点自然是论文正文内容，因此论文查重主要查的就是论文正文内容部分，其次就是论文摘要、关键词、引言和附录等部分内容。有些高校期刊社会有明确规定论文查重主要是查哪些部分或者是会规定只要查哪些部分，大家可以根据自己本校的规定或者是自己投稿期刊的要求进行查重，可以联系这些相关单位机构的工作人员进行一个了解。
知网一般会根据论文的目录以及格式等对大家提交的论文划分段落章节进行查重，而且现在知网论文查重系统随着技术的升级，对论文正文中的图片、表格、数理公式、编程语言代码等内容也是能够识别并进行对比查重的，不过还不精确，还在逐步完善中。
参考资料：《论文查重主要查什么?》
论文查重通常是对论文中的文本内容进行比对和分析，以检测其中是否存在抄袭、剽窃等学术不端行为。具体来说，论文查重系统通常会对以下几个方面进行检测：
论文正文部分：包括引言、文献综述、研究方法、研究结果、讨论与结论等。
论文的附录部分：包括问卷、数据采集方法、统计数据分析等。
论文的参考文献部分：包括论文引用的参考文献、注释、致谢等。
论文的图表部分：包括论文中使用的表格、图形、图像等。
其他部分：包括封面、目录、版权声明等。
在比对过程中，查重系统会将论文与已有的文献数据库进行比对，计算出每个段落或句子的相似度，并将其标记为重复或非重复。如果论文的重复率超过了学校或学院设定的阈值，就可能被认定为存在学术不端行为，影响学生的毕业和学位认证。
需要注意的是，不同的学校或期刊可能对论文查重的范围有不同的要求，因此具体范围可能会根据具体情况而有所不同。在查重时，建议遵循学校或期刊的要求，以确保查重结果的准确性和可靠性。同时，为了避免被误判为重复内容，建议在撰写论文时注重引用和参考文献的规范，避免过度借鉴他人作品或直接复制粘贴他人内容。