1、用途不同
神舟系列航天器主要是载人任务,包括与空间站对接,往太空送人。嫦娥系列主要是探索月球,以后嫦娥也会送人到月球。
2、目标不同
‘嫦娥’系列：获取月球表面三维影像。划分月球表面的基本地貌构造单元，初步编制月球地质与构造纲要图，为后续优选软着陆提供参考依据。分析月球表面有用元素含量和物质类型的分布特点。对月球表面有用元素进行探测，初步编制各元素的月面分布图。
神舟’系列：根据飞行任务规划，空间站工程分为关键技术验证，建造和运营分3个阶段实施，其中关键技术验证阶段安排了长征五号B运载火箭首飞、天和一号试验核心舱、神舟飞船、天舟飞船等6次飞行任务;建造阶段安排了问天舱、梦天舱、神舟飞船、天舟飞船等6次飞行任务。
扩展资料
‘嫦娥’系列主要概况
发射人造地球卫星、载人航天和深空探测是人类航天活动的三大领域。重返月球，开发月球资源，建立月球基地已成为世界航天活动的必然趋势和竞争热点。开展月球探测工作是我国迈出航天深空探测第一步的重大举措。实现月球探测将是我国航天深空探测零的突破。
月球已成为未来航天大国争夺战略资源的焦点。月球具有可供人类开发和利用的各种独特资源，月球上特有的矿产和能源，是对地球资源的重要补充和储备，将对人类社会的可持续发展产生深远影响。中国探月是我国自主对月球的探索和观察，又叫做嫦娥工程。
国务院正式批准绕月探测工程立项后，绕月探测工程领导小组将工程命名为“嫦娥工程”、将第一颗绕月卫星命名为“嫦娥一号”。
“嫦娥一号”卫星由中国空间技术研究院承担研制，主要用于获取月球表面三维影像、分析月球表面有关物质元素的分布特点、探测月壤厚度、探测地月空间环境等。嫦娥四号是嫦娥三号的备份星。而根据中国探月工程“绕”、“落”、“回”三步走战略。并计划在月球建立研究基地。
参考资料来源：百度百科-神州飞船
参考资料来源：百度百科-中国探月工程
附：神舟七号载人航天飞船,2008年9月25日晚21时10分04秒在酒泉卫星发射中心发射升空,9月27日下午16时30分航天员翟志刚首次进行出舱活动, 成为中国太空行走第一人。北京时间二十四日18时05分，西昌卫星发射中心用“长征三号甲”运载火箭将“嫦娥一号”卫星成功送入太空。预计嫦娥二号将于2010年发射。
参考资料：如果您的回答是从其他地方引用，请表明出处
本回答被提问者和网友采纳附：神舟七号载人航天飞船,2008年9月25日晚21时10分04秒在酒泉卫星发射中心发射升空,9月27日下午16时30分航天员翟志刚首次进行出舱活动, 成为中国太空行走第一人。北京时间二十四日18时05分，西昌卫星发射中心用“长征三号甲”运载火箭将“嫦娥一号”卫星成功送入太空。预计嫦娥二号将于2010年发射。