根据谭其骧先生编辑的《中国历史地图集》（共八册）及涟城南七里的青莲岗、涟城北二十五里的三里墩两处出土文物推断，青莲岗、涟城、三里墩、五港基本在一条海岸线上，早在五六千年之前，已有人类居住在五港这块土地上。
五港在涟水东北，距县城六十里，它是因有团墟河（此河在五港口东）、七里河（在五港东北），遏蛮河（在五港口北）、平旺河（在五港口北），官河五水在此汇流，故而得名五港。
五港东面古时是大海，它是涟水北边重镇，是重要的门户，是这一带地区政治、经济、交通中心。这儿曾设过巡检署，河伯所署，税课司署。
五港在明初已建镇。
明时，县以下设自治组织，设路设镇。当时，安东设两路九镇：两路：东路、西路；九镇：阜民镇、五港镇、大飞镇、潮河镇、岔庙镇、陈溪镇、金城镇、长乐镇、渔场镇。
五港此时设镇，是安东县九镇之一，距今已有644年历史，可谓千年古镇。
清承明制。
民国时期。
民国元年（1912年），北洋政府统治时期，涟水区划改两路九镇为六市七乡。六市：本城东路、西路、金岔、五港、大飞；七乡：保滩、久安、阜民、渔场、长乐、潮河、陈溪。从民国元年到民国十七年（1928年），五港叫五港市。
民国十八年（1929年），南京政府统治时期，涟水区划改六市七乡为九个区，279个乡镇，五港镇属第七区，第七区区公所原设大新集，后设在陈家港。第七区仍系五港原有区域。
民国二十三年（1934年），涟水区划改九个区为七个区，将279个乡镇合并为148个乡镇，此时五港镇属第四区，第四区区公所设在郑谭口。
日伪时期，涟水区划没有变化。
民国三十五年（1946年）12月以后，国民党重占涟水，对原七区148个乡镇曾作三次调整：第一次是民国三十六年（1947年），将原七区148个乡镇合并为一个直辖镇（辖一镇二乡）和七个区（辖46个乡镇），此时，五港镇属第四区；第二次是民国三十六年七月，将直辖乡撤销，全县重划为七个区148个乡镇，此时五港镇还属于第四区；第三次是民国三十七年（1948年）二月八日，将七个区148个乡镇合并为一个直属乡镇（辖一镇四乡），四个区（144个乡镇），此时五港镇属第三区。
民主建政以后时期。
民国二十九年（1940年）八月二十七日，共产党领导的涟水县抗日民主政府成立，区划没变，仍沿袭国民党政府的区划。民国三十年（1941年）元月二十四日，以盐河为界，涟水县划分为涟水、涟东两县，划后的涟水县辖原一、二、三三个区（一区的大部分），涟东县辖四、六、七三个区，原五区划给滨海。此时五港镇属涟东县。
民国三十年二月，涟东县将原辖七、六、四三区改为一、二、三区，此时五港属第三区；同年十一月，又增四、五两区，将二、三区一帆河以西、大东以北，新集以南划为五区，此时五港属涟东县第五区。民国三十一年（1942年）十一月至民国三十二年（1943年）一月，涟东县将五个区改为六个区；南集区、徐集区、黄营区、大东区、佃湖区、百禄区。此时五港属百禄区。
民国三十二年一月，涟东县又将六个区并为三个区，五港仍属第三区，到六月又划为一、二、三、四、五区，五港属第五区；到民国三十四年（1945年）春（除敌占区外），涟东又划为十三个小区，五港属南禄区；民国三十四年八月，日寇投降，民国三十五年（1946年）9月，涟东县将十八个区（涟城解放后又新划五个区——笔者注），合并为九个区：徐集区、大东区、南集区、黄营区、百禄区、锡思区、涟城区、五港区、繁志区。此时，五港设区。民国三十五年十二月，国民党占据涟城，这时涟东县由九个区合并为四个区：南集、黄营、百禄、胡集四个区，此时五港属胡集区；民国三十六年（1947年）五月，涟东县又划分八个区：南集区、涟城区、秉同区、百禄区、锡思区、黄营区、胡集区、五港区。此时五港又设区，直到建国后。
建国后。
1950年6月13日，涟水、涟东两县合并，仍叫涟水县。合并后涟水县为15个区169个乡，一个直县属场：王集区（12个乡）、官荡区（9个乡）、灰墩区（13个乡）、成集区（11个乡）、同兴区（11个乡）、岔庙区（12个乡）、高沟区（13个乡）、黄营区（12个乡）、胡集区（9个乡）、南集区（11个乡）、秉同区（11个乡）、涟城区（12个乡）、锡思区（12个乡）、百禄区（10个乡）、五港区（11个乡），南门试种场。此时五港仍叫区。
1954年6月，涟水对区乡镇建制作了调整，全县分十二区、二个镇，160个乡：王集区（12个乡）、灰墩区（13个乡）、高沟区（12个乡）、成集区（14个乡）、秉同区（16个乡）、黄营区（14个乡）、五港区（15个乡：五港、港西、港东、港南、港北、钦工、斗墩、埝口、罗冲、莲花、鲁渡、胡集、小埝、盐岔、新平），岔庙区（12个乡）、同兴区（11个乡）、百禄区（15个乡）、南集区（13个乡）、涟城区（13个乡）、涟城镇、高沟镇，此时五港仍叫区。
1956年2月，县将原有12个区划分为8个区，160个乡并为81个乡，两个县属镇改为涟城镇一个县属镇，八区一镇是：王集区、灰墩区、高沟区、成集区、秉同区、黄营区、五港区、百禄区、涟城镇。此时五港仍叫区。
1957年12月10日，经省批准撤销8个区、81个乡，成立27个乡和1个镇，即：高沟乡、王集乡、成集乡、灰墩乡、红窑乡、五港乡、百禄乡、保滩乡、李集乡、唐集乡、南集乡、大东乡、同兴乡、梁岔乡、杨口乡、陈师乡、麻垛乡、岔庙乡、胡集乡、徐集乡、蒋庵乡、花园乡、新集乡、六塘乡、硕湖乡、南禄乡、黄营乡、涟城镇。此时五港叫五港乡。
1957年12月21日，新建灌南县，省人委决定将涟水的百禄、花园、新集、六塘、硕湖五个乡划给灌南，这时，全县还有22个乡、一个镇。
1958年8月，全县成立21个人民公社：胡集、东风、徐集、保滩、李集、大东、红窑、麻垛、灰墩、成集、同兴、陈师、五港、梁岔、唐集、南禄、高沟、岔庙、蒋庵、黄营、南集。此时五港叫五港人民公社。
以后涟水区划又有变更，但五港人民公社没变。
1983年，政社分开，人民公社一律改称为乡人民政府。此时涟水有30个乡、2个镇、8个场圃。30个乡：徐集、南集、北集、黄营、唐集、南禄、方渡、五港、胡集、东风、河网、红星、浅集、红窑、红灯、义兴、高沟、杨口、涟淮、双河、成集、梁岔、保滩、牌坊、李集、时码、大东、前进、麻垛、余圩；2个镇：涟城镇、高沟镇；8个场圃：城南果园、石湖果园、城东林场、马棚原种场、朱陈苗圃、良种场、蚕桑场、药材场。此时五港叫五港乡。
1986年以后，全国兴建小城镇。经省政府批准，1988年，改五港乡为五港镇。这以后，五港一直叫“五港镇”，直至今天（2012年）。
五港镇，从明初1368年建镇，直至清末，一直叫“五港镇”；民国元年至民国十八年，五港叫“五港市”，民国十八年至民国二十三年，五港镇属第七区；民国二十三年至民国三十五年，五港镇属第四区；民国三十五年12月以后，国民党县政府曾对涟水区划进行三次调整，五港镇先后属第四区、第四区、第三区。
民主建政以后，五港开始属涟水县第四区，1941年元月24日，涟水县抗日民主政府成立。五港镇先后属涟东县第三区、第五区、佃湖区、第三区、第五区、南禄区。1946年9月，成立五港区，直至建国。
1950年6月13日，涟水、涟东两县合并叫涟水县，仍设五港区，直至1957年12月。
1957年12月14日，成立乡，五港区改为五港乡，1958年8月，成立人民公社，五港乡改为五港人民公社，1983年，政社分开，五港人民公社又改为五港乡，1988年，经省政府批准，五港乡改为五港镇，又恢复镇的建制，一直至今（2012年）。
五港历史悠久，已有几千年历史，从明初开始建镇，距今已有644年，真可谓是“千年古镇五港”。
从光绪本《安东县志》得知：明清时，在五港镇内，有五港口集、佃湖集、圩、殷家圩、薛下庄圩，有五港口渡；在治东六十里，黄成章置，有官船一只，有遏蛮河桥；在治东七十里，有平旺河桥；在治东北八十里，还有平旺河渡。
五港镇内还有广佛古寺，钟鼓庙等。 五港镇着力落实“五大举措”。一是强化宣传发动，坚持“发展为第一要务、创业为第一追求、富民为第一责任”的思想，凝聚人心，积极营造宣传舆论声势，把敢于创业、争先创业、艰苦创业的精神宣传到千家万户。二是放大能人效应，树立创业典型，宣传创业标兵，增强其辐射能力，带动周围群众共同致富。三是增强技术培训，充分发挥本地“土专家”的传帮带作用，并定期组织镇村干部和群众代表外出考察学习，开阔视野，拓宽思路，切实解决“想创业，缺技术”的瓶颈，提高创业水平。四是实行政策激励，加大技改力度，通过技改扩大投入的项目，视同新招项目，享受政策优惠，新增的入库税收按照一定比例给予奖励。五是优化服务环境，着力打造优质、高效、到位的服务品牌，做到多服务不干预、多帮忙不添乱、多设路标不设路障，为创业者提供“保姆式”、“一站式”服务。
