如果要将多个文件夹下的子文件夹合并到新建的文件夹下面，可以使用命令行或第三方工具来实现。
命令行：使用 Windows 命令行或 Linux/macOS 终端可以使用 xcopy 命令来实现这个功能。
例如:
xcopy "C:\SourceFolder" "C:\DestinationFolder" /E /I
在上面的命令中，SourceFolder 是你想要合并的文件夹路径，DestinationFolder 是新建的文件夹路径。/E 参数表示将所有子文件夹和文件复制到目标文件夹中，/I 参数表示如果目标文件夹不存在则自动创建。
第三方工具: 也可以使用第三方工具，如Teracopy,FastCopy,EaseUS Todo PCTrans等软件来进行文件夹合并。
都可以提供图形化界面,选择需要合并的文件夹,一键完成合并。可能有免费试用版本，建议可以先使用试用版本试试.
这对于命令行或第三方工具，在进行文件夹合并操作时需要格外小心，确保不会覆盖或丢失原有的文件。如果可能的话，建议先做好备份，并在合并文件夹之前确认文件夹内容是否正确。
合并文件夹前还需要注意源文件夹是否按照预期情况准备好,比如重命名，移动文件夹等操作。
需要注意的是,合并文件夹并不会删除源文件夹中的文件，所以合并后需要手动删除.
在使用命令行或第三方工具进行文件夹合并操作时，还可以考虑一些其他的选项和参数来调整合并文件夹的方式。
例如：
使用 /Y 参数来覆盖同名文件，而不需要确认。
使用 /S 参数来将文件夹中的子文件夹也复制到新文件夹中。
使用 /Z 参数来在高拷贝文件期间断开网络连接。
使用 /L 参数来模拟文件复制过程，而不实际复制文件。
在使用第三方工具时，可以查看其使用文档，了解更多关于复制参数和选项的信息。
总之,在进行文件夹合并时，需要根据实际情况进行选择，并且在操作前做好充分的准备,防范风险,避免数据丢失.