省医保是属于省医保中心管理，市医保属于市医保中心管理，其属性都是属于城镇职工医疗保险。其主要的区别有以下几个方面：
第一，统筹区不一样。
在我国的职工医疗保险还没有实现省级统筹之前，职工医疗保险是按照地市级作为统筹单位，在一个省的范围内，养老保险关系在哪里缴纳，医疗保险关系也就在哪里缴纳，按照过去的管理方式，省级社保中心负责省级社保的缴纳，那么在省级医保中心的缴纳的医保，就属于省级医保；在市级社保中心缴纳的社保属于市社保，在市级医保中心缴费缴纳的医保，也就是属于市医保。按照省级行政单位的划分，分为若干个地市和省级机关，各个地市和省级机关分别作为一个不同的统筹区，在地市范围内缴纳的医保属于市医保，在省级机关统筹区缴纳的医保，属于省级医保。
第二，缴费对象不一样。
省级医保主要的参保对象为省级机关事业单位的职工，中央派驻到省级机构的单位职工，中央所属企业派驻省级的机构，省属企业的职工；在省级工商行政管理部门注册的企业职工，档案在省级人才交流中心的管理的人员等，职工养老保险在省级社保中心管理的人员等；市级医保的参保对象为省级参保对象之外的人员，包括本市的机关事业单位工作人员，企业职工和户籍在本市的灵活就业人员、档案在市县人才交流中心管理的人员等。
第三，缴费基数不一样。
社保的缴费基数，在实现省级统筹以后养老保险的缴费基数基本上实现了统一，都是由省级社保部门统一划定社保缴费的上限和下限，但是医疗保险还没有实现省级统筹，还是以统筹区规定的缴费基数作为缴费基数，同样需要划定缴费基数的上限和下限，但是是由统筹区来划定。市医保是有各个市级统筹区来划定，省级医保是有省医保中心来划定。由于省级机关职工的平均工资水平要高于各个地市，所以省级的医保的缴费基数更高。
第四，定点医院不一样。
地市级医保，定点医院都是在本市的范围之内，不能将市外的医院划为定点医院。但省级医保定点医院可以将省级医院列为定点医院，也可以将分散在全省各地的省级医院列为定点医院，还可以将部分市级医院确定为定点医院。
第五，省医保和市医保关系可以互转。
省医保和医保虽然不属于同一个统筹区，如果调动或是工作变动等，医保关系可以随工作的调动而转移。比如从成都市调动到省级机关工作的，可将成都市的医保转移到省级医保中心，缴费年限可以互认，缴费年限可以累计计算，所缴纳的医保费用可以转移。
第六，省医保和市医保跨统筹区就医属于异地就医。
如果缴纳的省医保，到市医保的定点医院看病就医，需要办理异地就医备案，才能通过异地就医系统才能结算，不过现在随着省级医保统筹的步伐的加快，医保实现全省联网以后，就不再需要办理异地就医备案。同时如果属于外地转入的，比如从重庆转入四川的医保，就需要先确定是转入省级医保还是市级医保。比如转入成都市的，如果转入省级医保，只能指定一家省级医疗机构作为定点医院，转入成都市的不能指定省级医院作为定点医院，只能指定成都市所属的定点医院作为定点医院。
综上所述，省医保和市医保的区别归纳起来就是两句话，省医保是在省医保中心办理的医保，市医保是在市县医保中心办理的医保。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费
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