温州南站连接甬台温客运专线(甬台温铁路),温福客运专线(温福铁路)和新金温铁路。经停车次一律为动车/高铁列车。温州南站北可直达北京、南京、上海、杭州等地,南可直达深圳、厦门、福州等地,西可直达贵阳,长沙,南昌,武汉等地。未来还将连接杭温高铁(预计2017年开建)、温武铁路(温州-武夷山,规划中)等铁路。
而温州站是老火车站,经停普通火车。
温州站是浙江金温铁道开发有限公司直属的“金温铁路”上的一等客运站,是温州市交通行业最大的“窗口”单位。车站占地面积15万平方米,主站房建筑面积3.6万平方米,拥有近6.5万平方米的站前广场,现有4个站台10条股道。