一、企业门门槛不同。
基础层、创新层对挂牌企业的要求不同。
二、交易机制不同。
基础层、创新层采用的是
集合竞价交易方式，基础层每一个小时撮合一次，创新层.每10分钟撮合一次。
三、投资者i门槛不同。
基础层、创新层对投资者的资金要求不同，基础层要求投资人前10个交易日账户资产日均不低于200万元，创新层是100万元。
【拓展资料】
所谓“创新层”，是指根据
新三板分层制度的有关规定，
全国股转系统将所有在新三板挂牌的公司，划分为创新层和基础层两个层级，符合不同标准的挂牌公司分别纳入创新层或基础层管理。
通过内部分层，可以在交易制度、发行制度、
信息披露的要求等制度供给方面，进行差异化的安排，以最终达成新三板市场持续、健康发展的目标。
挂牌公司所属市场层级及其调整，不代表
全国股转公司对挂牌公司投资价值的判断。
新三板：
三板市场起源于2001年“股权代办转让系统”，最早承接两网公司和退市公司，称为“旧三板”。2006年，
中关村科技园区非上市股份公司进入代办转让系统进行股份报价转让，称为“新三板”。2013年12月31日起股转系统面向全国接收企业挂牌申请。
随着新三板市场的逐步完善，我国将逐步形成可以满足各种投融资服务需求的多层次资本市场体系。
市场投资风险：
无论对于创新层还是基础层股票，投资新三板都有可能为投资者带来巨大财富，但也可能让投资者面临巨大风险，这也是新三板市场设置较高的投资者准入门槛的重要原因。
目前，新三板市场投资风险主要包括如下几种类型：挂牌企业运营风险、公司信息披露风险、市场
流动性风险、管理制度变迁风险等等。